Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-7.79□□□□□ -3.66
CENPFP49454 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC-7.8□□□□□ -3.66
CENPFP49454 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC-7.81□□□□□ -3.66
CENPFP49454 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC-7.82□□□□□ -3.66
CENPFP49454 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC-7.86□□□□□ -3.67
CENPFP49454 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC-7.87□□□□□ -3.67
CENPFP49454 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC-7.88□□□□□ -3.67
CENPFP49454 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC-7.88□□□□□ -3.67
CENPFP49454 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC-7.88□□□□□ -3.67
CENPFP49454 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC-7.91□□□□□ -3.68
CENPFP49454 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC-7.91□□□□□ -3.68
CENPFP49454 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-7.92□□□□□ -3.68
CENPFP49454 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC-7.93□□□□□ -3.68
CENPFP49454 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC-7.93□□□□□ -3.68
CENPFP49454 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC-7.95□□□□□ -3.68
CENPFP49454 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC-7.98□□□□□ -3.69
CENPFP49454 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-7.99□□□□□ -3.69
CENPFP49454 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC-8.01□□□□□ -3.69
CENPFP49454 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC-8.01□□□□□ -3.69
CENPFP49454 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC-8.02□□□□□ -3.69
CENPFP49454 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC-8.02□□□□□ -3.69
CENPFP49454 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC-8.03□□□□□ -3.69
CENPFP49454 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC-8.06□□□□□ -3.7
CENPFP49454 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC-8.07□□□□□ -3.7
CENPFP49454 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC-8.08□□□□□ -3.7
CENPFP49454 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC-8.08□□□□□ -3.7
CENPFP49454 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-8.11□□□□□ -3.71
CENPFP49454 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-8.11□□□□□ -3.71
CENPFP49454 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-8.11□□□□□ -3.71
CENPFP49454 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC-8.12□□□□□ -3.71
CENPFP49454 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC-8.12□□□□□ -3.71
CENPFP49454 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC-8.12□□□□□ -3.71
CENPFP49454 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC-8.12□□□□□ -3.71
CENPFP49454 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC-8.16□□□□□ -3.72
CENPFP49454 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC-8.16□□□□□ -3.72
CENPFP49454 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-8.2□□□□□ -3.72
CENPFP49454 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC-8.21□□□□□ -3.72
CENPFP49454 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC-8.21□□□□□ -3.72
CENPFP49454 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC-8.22□□□□□ -3.72
CENPFP49454 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC-8.24□□□□□ -3.73
CENPFP49454 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-8.24□□□□□ -3.73
CENPFP49454 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC-8.24□□□□□ -3.73
CENPFP49454 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-8.25□□□□□ -3.73
CENPFP49454 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC-8.26□□□□□ -3.73
CENPFP49454 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC-8.28□□□□□ -3.73
CENPFP49454 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC-8.28□□□□□ -3.74
CENPFP49454 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-8.33□□□□□ -3.74
CENPFP49454 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC-8.34□□□□□ -3.74
CENPFP49454 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC-8.35□□□□□ -3.75
CENPFP49454 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-8.36□□□□□ -3.75
CENPFP49454 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC-8.39□□□□□ -3.75
CENPFP49454 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC-8.42□□□□□ -3.76
CENPFP49454 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC-8.42□□□□□ -3.76
CENPFP49454 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-8.45□□□□□ -3.76
CENPFP49454 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC-8.46□□□□□ -3.76
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CENPFP49454 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC-8.49□□□□□ -3.77
CENPFP49454 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-8.52□□□□□ -3.77
CENPFP49454 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC-8.54□□□□□ -3.78
CENPFP49454 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC-8.55□□□□□ -3.78
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CENPFP49454 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-8.59□□□□□ -3.78
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CENPFP49454 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-8.63□□□□□ -3.79
CENPFP49454 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC-8.63□□□□□ -3.79
CENPFP49454 SNORD73B-201ENST00000364394 72 ntBASIC-8.64□□□□□ -3.79
CENPFP49454 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC-8.65□□□□□ -3.79
CENPFP49454 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC-8.7□□□□□ -3.8
CENPFP49454 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC-8.75□□□□□ -3.81
CENPFP49454 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC-8.75□□□□□ -3.81
CENPFP49454 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC-8.76□□□□□ -3.81
CENPFP49454 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC-8.76□□□□□ -3.81
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CENPFP49454 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC-9.22□□□□□ -3.89
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CENPFP49454 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC-9.25□□□□□ -3.89
CENPFP49454 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC-9.25□□□□□ -3.89
CENPFP49454 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC-9.27□□□□□ -3.89
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CENPFP49454 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC-9.44□□□□□ -3.92
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