Protein–RNA interactions for Protein: Q96RW7

HMCN1, Hemicentin-1, humanhuman

Predictions only

Length 5,635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMCN1Q96RW7 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC0.19□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC0.18□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 MIR6076-201ENST00000617521 113 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 MIR506-201ENST00000384998 124 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 RNU6-202P-201ENST00000515998 96 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC0.16□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC0.15□□□□□ -2.38
HMCN1Q96RW7 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 MIR520C-201ENST00000385005 87 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 RNU7-99P-201ENST00000516271 62 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.12□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC0.12□□□□□ -2.39
HMCN1Q96RW7 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
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