Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SNAPC1Q16533 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SNAPC1Q16533 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SNAPC1Q16533 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SNAPC1Q16533 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SNAPC1Q16533 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SNAPC1Q16533 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SNAPC1Q16533 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SNAPC1Q16533 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SNAPC1Q16533 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SNAPC1Q16533 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SNAPC1Q16533 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SNAPC1Q16533 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SNAPC1Q16533 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SNAPC1Q16533 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SNAPC1Q16533 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SNAPC1Q16533 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SNAPC1Q16533 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SNAPC1Q16533 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SNAPC1Q16533 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SNAPC1Q16533 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SNAPC1Q16533 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SNAPC1Q16533 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
SNAPC1Q16533 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SNAPC1Q16533 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SNAPC1Q16533 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
SNAPC1Q16533 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SNAPC1Q16533 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SNAPC1Q16533 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
SNAPC1Q16533 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SNAPC1Q16533 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
SNAPC1Q16533 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
SNAPC1Q16533 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
SNAPC1Q16533 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SNAPC1Q16533 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
SNAPC1Q16533 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
SNAPC1Q16533 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
SNAPC1Q16533 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
SNAPC1Q16533 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
SNAPC1Q16533 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
SNAPC1Q16533 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
SNAPC1Q16533 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SNAPC1Q16533 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
SNAPC1Q16533 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.35□□□□□ -2.79
SNAPC1Q16533 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
SNAPC1Q16533 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.36□□□□□ -2.79
SNAPC1Q16533 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
SNAPC1Q16533 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
SNAPC1Q16533 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
SNAPC1Q16533 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
SNAPC1Q16533 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-2.38□□□□□ -2.79
SNAPC1Q16533 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
SNAPC1Q16533 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
SNAPC1Q16533 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
SNAPC1Q16533 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
SNAPC1Q16533 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
SNAPC1Q16533 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
SNAPC1Q16533 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SNAPC1Q16533 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SNAPC1Q16533 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SNAPC1Q16533 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
SNAPC1Q16533 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
SNAPC1Q16533 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SNAPC1Q16533 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SNAPC1Q16533 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SNAPC1Q16533 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SNAPC1Q16533 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SNAPC1Q16533 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SNAPC1Q16533 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SNAPC1Q16533 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SNAPC1Q16533 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
SNAPC1Q16533 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
SNAPC1Q16533 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
SNAPC1Q16533 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SNAPC1Q16533 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
SNAPC1Q16533 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SNAPC1Q16533 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-2.48□□□□□ -2.81
SNAPC1Q16533 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SNAPC1Q16533 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SNAPC1Q16533 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-2.49□□□□□ -2.81
SNAPC1Q16533 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SNAPC1Q16533 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SNAPC1Q16533 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
SNAPC1Q16533 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
SNAPC1Q16533 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
SNAPC1Q16533 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC-2.54□□□□□ -2.82
SNAPC1Q16533 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
SNAPC1Q16533 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC-2.56□□□□□ -2.82
SNAPC1Q16533 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
SNAPC1Q16533 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
SNAPC1Q16533 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
SNAPC1Q16533 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC-2.58□□□□□ -2.82
SNAPC1Q16533 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
SNAPC1Q16533 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
SNAPC1Q16533 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-2.61□□□□□ -2.83
SNAPC1Q16533 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
SNAPC1Q16533 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
SNAPC1Q16533 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
SNAPC1Q16533 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
SNAPC1Q16533 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms