Protein–RNA interactions for Protein: Q14653

IRF3, Interferon regulatory factor 3, humanhuman

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Length 427 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF3Q14653 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
IRF3Q14653 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
IRF3Q14653 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
IRF3Q14653 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
IRF3Q14653 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
IRF3Q14653 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
IRF3Q14653 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
IRF3Q14653 Y_RNA.388-201ENST00000383919 113 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
IRF3Q14653 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
IRF3Q14653 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
IRF3Q14653 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
IRF3Q14653 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
IRF3Q14653 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
IRF3Q14653 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
IRF3Q14653 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
IRF3Q14653 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
IRF3Q14653 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
IRF3Q14653 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
IRF3Q14653 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
IRF3Q14653 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
IRF3Q14653 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
IRF3Q14653 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
IRF3Q14653 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
IRF3Q14653 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
IRF3Q14653 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
IRF3Q14653 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
IRF3Q14653 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
IRF3Q14653 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
IRF3Q14653 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-2.3□□□□□ -2.78
IRF3Q14653 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
IRF3Q14653 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
IRF3Q14653 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
IRF3Q14653 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
IRF3Q14653 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
IRF3Q14653 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
IRF3Q14653 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
IRF3Q14653 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
IRF3Q14653 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
IRF3Q14653 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
IRF3Q14653 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
IRF3Q14653 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
IRF3Q14653 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
IRF3Q14653 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
IRF3Q14653 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
IRF3Q14653 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
IRF3Q14653 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
IRF3Q14653 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
IRF3Q14653 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
IRF3Q14653 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
IRF3Q14653 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
IRF3Q14653 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
IRF3Q14653 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
IRF3Q14653 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
IRF3Q14653 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
IRF3Q14653 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
IRF3Q14653 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
IRF3Q14653 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-2.47□□□□□ -2.8
IRF3Q14653 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-2.5□□□□□ -2.81
IRF3Q14653 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-2.52□□□□□ -2.81
IRF3Q14653 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
IRF3Q14653 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-2.53□□□□□ -2.81
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IRF3Q14653 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-2.55□□□□□ -2.82
IRF3Q14653 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.55□□□□□ -2.82
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IRF3Q14653 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.57□□□□□ -2.82
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IRF3Q14653 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
IRF3Q14653 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-2.59□□□□□ -2.82
IRF3Q14653 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
IRF3Q14653 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC-2.6□□□□□ -2.83
IRF3Q14653 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
IRF3Q14653 RNU6-230P-201ENST00000362457 104 ntBASIC-2.62□□□□□ -2.83
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IRF3Q14653 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-2.63□□□□□ -2.83
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IRF3Q14653 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
IRF3Q14653 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC-2.64□□□□□ -2.83
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IRF3Q14653 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
IRF3Q14653 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
IRF3Q14653 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
IRF3Q14653 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
IRF3Q14653 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
IRF3Q14653 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
IRF3Q14653 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
IRF3Q14653 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
IRF3Q14653 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
IRF3Q14653 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
IRF3Q14653 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
IRF3Q14653 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
IRF3Q14653 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
IRF3Q14653 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
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