Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PDE7AQ13946 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PDE7AQ13946 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
PDE7AQ13946 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PDE7AQ13946 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PDE7AQ13946 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PDE7AQ13946 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PDE7AQ13946 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
PDE7AQ13946 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PDE7AQ13946 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PDE7AQ13946 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
PDE7AQ13946 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PDE7AQ13946 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PDE7AQ13946 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PDE7AQ13946 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PDE7AQ13946 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PDE7AQ13946 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
PDE7AQ13946 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PDE7AQ13946 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PDE7AQ13946 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PDE7AQ13946 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PDE7AQ13946 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
PDE7AQ13946 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.53□□□□□ -2.65
PDE7AQ13946 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PDE7AQ13946 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PDE7AQ13946 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PDE7AQ13946 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PDE7AQ13946 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
PDE7AQ13946 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PDE7AQ13946 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PDE7AQ13946 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PDE7AQ13946 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
PDE7AQ13946 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PDE7AQ13946 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PDE7AQ13946 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PDE7AQ13946 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PDE7AQ13946 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PDE7AQ13946 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
PDE7AQ13946 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PDE7AQ13946 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PDE7AQ13946 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
PDE7AQ13946 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PDE7AQ13946 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
PDE7AQ13946 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PDE7AQ13946 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PDE7AQ13946 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PDE7AQ13946 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PDE7AQ13946 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PDE7AQ13946 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PDE7AQ13946 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PDE7AQ13946 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PDE7AQ13946 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
PDE7AQ13946 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.61□□□□□ -2.67
PDE7AQ13946 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PDE7AQ13946 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PDE7AQ13946 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PDE7AQ13946 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PDE7AQ13946 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
PDE7AQ13946 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
PDE7AQ13946 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PDE7AQ13946 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PDE7AQ13946 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
PDE7AQ13946 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PDE7AQ13946 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PDE7AQ13946 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PDE7AQ13946 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PDE7AQ13946 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PDE7AQ13946 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
PDE7AQ13946 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
PDE7AQ13946 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PDE7AQ13946 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PDE7AQ13946 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
PDE7AQ13946 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
PDE7AQ13946 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
PDE7AQ13946 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PDE7AQ13946 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
PDE7AQ13946 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
PDE7AQ13946 Y_RNA.63-201ENST00000362841 102 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
PDE7AQ13946 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
PDE7AQ13946 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PDE7AQ13946 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PDE7AQ13946 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PDE7AQ13946 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PDE7AQ13946 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-1.74□□□□□ -2.69
PDE7AQ13946 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PDE7AQ13946 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PDE7AQ13946 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PDE7AQ13946 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PDE7AQ13946 RNY4P9-201ENST00000363194 97 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
PDE7AQ13946 RNU6-345P-201ENST00000517001 107 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
PDE7AQ13946 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PDE7AQ13946 SNX3P1Y-201ENST00000615757 176 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PDE7AQ13946 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PDE7AQ13946 Y_RNA.513-201ENST00000384522 100 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PDE7AQ13946 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PDE7AQ13946 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PDE7AQ13946 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PDE7AQ13946 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PDE7AQ13946 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PDE7AQ13946 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 268.2 ms