Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CACNA1CQ13936 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CACNA1CQ13936 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
CACNA1CQ13936 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CACNA1CQ13936 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CACNA1CQ13936 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CACNA1CQ13936 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
CACNA1CQ13936 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CACNA1CQ13936 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-1.54□□□□□ -2.66
CACNA1CQ13936 AL359920.1-201ENST00000618332 176 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CACNA1CQ13936 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CACNA1CQ13936 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CACNA1CQ13936 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
CACNA1CQ13936 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CACNA1CQ13936 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CACNA1CQ13936 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CACNA1CQ13936 MIR656-201ENST00000385224 78 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CACNA1CQ13936 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.55□□□□□ -2.66
CACNA1CQ13936 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CACNA1CQ13936 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CACNA1CQ13936 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CACNA1CQ13936 MIR548AH-201ENST00000637109 76 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
CACNA1CQ13936 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CACNA1CQ13936 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CACNA1CQ13936 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CACNA1CQ13936 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-1.56□□□□□ -2.66
CACNA1CQ13936 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CACNA1CQ13936 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CACNA1CQ13936 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
CACNA1CQ13936 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CACNA1CQ13936 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CACNA1CQ13936 Y_RNA.663-201ENST00000516043 101 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CACNA1CQ13936 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
CACNA1CQ13936 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CACNA1CQ13936 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CACNA1CQ13936 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CACNA1CQ13936 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CACNA1CQ13936 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CACNA1CQ13936 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
CACNA1CQ13936 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CACNA1CQ13936 RNU6-1161P-201ENST00000516176 102 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CACNA1CQ13936 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CACNA1CQ13936 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CACNA1CQ13936 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CACNA1CQ13936 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CACNA1CQ13936 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CACNA1CQ13936 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CACNA1CQ13936 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CACNA1CQ13936 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
CACNA1CQ13936 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-1.6□□□□□ -2.67
CACNA1CQ13936 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
CACNA1CQ13936 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CACNA1CQ13936 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CACNA1CQ13936 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
CACNA1CQ13936 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CACNA1CQ13936 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CACNA1CQ13936 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CACNA1CQ13936 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CACNA1CQ13936 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
CACNA1CQ13936 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CACNA1CQ13936 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CACNA1CQ13936 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CACNA1CQ13936 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CACNA1CQ13936 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CACNA1CQ13936 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CACNA1CQ13936 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CACNA1CQ13936 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CACNA1CQ13936 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CACNA1CQ13936 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CACNA1CQ13936 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
CACNA1CQ13936 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CACNA1CQ13936 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CACNA1CQ13936 RNU6-665P-201ENST00000384639 107 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CACNA1CQ13936 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
CACNA1CQ13936 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CACNA1CQ13936 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
CACNA1CQ13936 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
CACNA1CQ13936 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
CACNA1CQ13936 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
CACNA1CQ13936 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CACNA1CQ13936 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
CACNA1CQ13936 RNU6-1255P-201ENST00000363434 112 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CACNA1CQ13936 Y_RNA.137-201ENST00000363455 112 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CACNA1CQ13936 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CACNA1CQ13936 RNU6-422P-201ENST00000384632 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CACNA1CQ13936 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
CACNA1CQ13936 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
CACNA1CQ13936 RNU6-1043P-201ENST00000410355 99 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
CACNA1CQ13936 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
CACNA1CQ13936 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
CACNA1CQ13936 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
CACNA1CQ13936 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
CACNA1CQ13936 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CACNA1CQ13936 RNU6-1154P-201ENST00000391001 104 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
CACNA1CQ13936 RNA5SP449-201ENST00000516871 130 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
CACNA1CQ13936 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
CACNA1CQ13936 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CACNA1CQ13936 MIR4679-1-201ENST00000637619 75 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CACNA1CQ13936 Y_RNA.406-201ENST00000383984 100 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
CACNA1CQ13936 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 881.7 ms