Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
GTF3C1Q12789 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
GTF3C1Q12789 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
GTF3C1Q12789 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
GTF3C1Q12789 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
GTF3C1Q12789 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
GTF3C1Q12789 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
GTF3C1Q12789 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
GTF3C1Q12789 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
GTF3C1Q12789 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
GTF3C1Q12789 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
GTF3C1Q12789 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
GTF3C1Q12789 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
GTF3C1Q12789 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
GTF3C1Q12789 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
GTF3C1Q12789 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
GTF3C1Q12789 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
GTF3C1Q12789 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
GTF3C1Q12789 Y_RNA.678-201ENST00000516408 96 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
GTF3C1Q12789 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
GTF3C1Q12789 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
GTF3C1Q12789 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
GTF3C1Q12789 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
GTF3C1Q12789 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
GTF3C1Q12789 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
GTF3C1Q12789 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
GTF3C1Q12789 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
GTF3C1Q12789 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
GTF3C1Q12789 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
GTF3C1Q12789 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
GTF3C1Q12789 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
GTF3C1Q12789 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
GTF3C1Q12789 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
GTF3C1Q12789 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
GTF3C1Q12789 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
GTF3C1Q12789 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
GTF3C1Q12789 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
GTF3C1Q12789 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
GTF3C1Q12789 MIR487B-201ENST00000385021 84 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
GTF3C1Q12789 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
GTF3C1Q12789 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
GTF3C1Q12789 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
GTF3C1Q12789 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
GTF3C1Q12789 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
GTF3C1Q12789 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
GTF3C1Q12789 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
GTF3C1Q12789 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
GTF3C1Q12789 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
GTF3C1Q12789 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
GTF3C1Q12789 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
GTF3C1Q12789 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.51□□□□□ -2.65
GTF3C1Q12789 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
GTF3C1Q12789 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
GTF3C1Q12789 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
GTF3C1Q12789 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
GTF3C1Q12789 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
GTF3C1Q12789 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.52□□□□□ -2.65
GTF3C1Q12789 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
GTF3C1Q12789 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
GTF3C1Q12789 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
GTF3C1Q12789 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
GTF3C1Q12789 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
GTF3C1Q12789 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
GTF3C1Q12789 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
GTF3C1Q12789 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
GTF3C1Q12789 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
GTF3C1Q12789 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
GTF3C1Q12789 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
GTF3C1Q12789 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
GTF3C1Q12789 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
GTF3C1Q12789 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
GTF3C1Q12789 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
GTF3C1Q12789 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
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GTF3C1Q12789 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
GTF3C1Q12789 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.59□□□□□ -2.66
GTF3C1Q12789 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
GTF3C1Q12789 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.66
GTF3C1Q12789 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.66
GTF3C1Q12789 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
GTF3C1Q12789 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
GTF3C1Q12789 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
GTF3C1Q12789 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
GTF3C1Q12789 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
GTF3C1Q12789 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
GTF3C1Q12789 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
GTF3C1Q12789 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
GTF3C1Q12789 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
GTF3C1Q12789 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
GTF3C1Q12789 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
GTF3C1Q12789 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.67
GTF3C1Q12789 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
GTF3C1Q12789 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
GTF3C1Q12789 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
GTF3C1Q12789 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
GTF3C1Q12789 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
GTF3C1Q12789 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
GTF3C1Q12789 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-1.68□□□□□ -2.68
GTF3C1Q12789 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
GTF3C1Q12789 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
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