Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
CLDN9O95484 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
CLDN9O95484 Y_RNA.830-201ENST00000628531 96 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
CLDN9O95484 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
CLDN9O95484 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
CLDN9O95484 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
CLDN9O95484 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
CLDN9O95484 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
CLDN9O95484 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
CLDN9O95484 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
CLDN9O95484 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
CLDN9O95484 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
CLDN9O95484 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
CLDN9O95484 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
CLDN9O95484 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
CLDN9O95484 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
CLDN9O95484 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
CLDN9O95484 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
CLDN9O95484 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
CLDN9O95484 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
CLDN9O95484 Y_RNA.519-201ENST00000384553 102 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
CLDN9O95484 Y_RNA.59-201ENST00000362828 102 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
CLDN9O95484 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
CLDN9O95484 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
CLDN9O95484 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
CLDN9O95484 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
CLDN9O95484 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
CLDN9O95484 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
CLDN9O95484 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
CLDN9O95484 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-2.89□□□□□ -2.87
CLDN9O95484 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
CLDN9O95484 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
CLDN9O95484 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
CLDN9O95484 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
CLDN9O95484 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
CLDN9O95484 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
CLDN9O95484 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
CLDN9O95484 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
CLDN9O95484 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
CLDN9O95484 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
CLDN9O95484 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
CLDN9O95484 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
CLDN9O95484 RNU6-1044P-201ENST00000384755 107 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
CLDN9O95484 RNY4P25-201ENST00000459254 96 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
CLDN9O95484 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
CLDN9O95484 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
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CLDN9O95484 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
CLDN9O95484 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
CLDN9O95484 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
CLDN9O95484 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
CLDN9O95484 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
CLDN9O95484 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
CLDN9O95484 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
CLDN9O95484 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
CLDN9O95484 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
CLDN9O95484 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
CLDN9O95484 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
CLDN9O95484 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
CLDN9O95484 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
CLDN9O95484 Y_RNA.266-201ENST00000364678 96 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
CLDN9O95484 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
CLDN9O95484 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
CLDN9O95484 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-3.05□□□□□ -2.9
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CLDN9O95484 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-3.06□□□□□ -2.9
CLDN9O95484 SNORD114-13-201ENST00000364377 74 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
CLDN9O95484 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
CLDN9O95484 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-3.07□□□□□ -2.9
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CLDN9O95484 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
CLDN9O95484 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
CLDN9O95484 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
CLDN9O95484 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
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CLDN9O95484 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
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CLDN9O95484 MIRLET7A3-201ENST00000362116 74 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
CLDN9O95484 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
CLDN9O95484 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
CLDN9O95484 AC062037.1-201ENST00000605302 128 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
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CLDN9O95484 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
CLDN9O95484 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
CLDN9O95484 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
CLDN9O95484 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
CLDN9O95484 RNU6-406P-201ENST00000516470 107 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
CLDN9O95484 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
CLDN9O95484 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
CLDN9O95484 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
CLDN9O95484 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
CLDN9O95484 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
CLDN9O95484 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
CLDN9O95484 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
CLDN9O95484 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
CLDN9O95484 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
CLDN9O95484 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-3.25□□□□□ -2.93
CLDN9O95484 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
CLDN9O95484 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
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