Protein–RNA interactions for Protein: O75200

NPIPB7, Nuclear pore complex-interacting protein family member B7, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB7O75200 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
NPIPB7O75200 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
NPIPB7O75200 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
NPIPB7O75200 AC108019.1-201ENST00000512540 175 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
NPIPB7O75200 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
NPIPB7O75200 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
NPIPB7O75200 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
NPIPB7O75200 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
NPIPB7O75200 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
NPIPB7O75200 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
NPIPB7O75200 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
NPIPB7O75200 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
NPIPB7O75200 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
NPIPB7O75200 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
NPIPB7O75200 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
NPIPB7O75200 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
NPIPB7O75200 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
NPIPB7O75200 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
NPIPB7O75200 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.8□□□□□ -2.7
NPIPB7O75200 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
NPIPB7O75200 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
NPIPB7O75200 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
NPIPB7O75200 MIR4756-201ENST00000577874 78 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
NPIPB7O75200 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
NPIPB7O75200 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
NPIPB7O75200 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
NPIPB7O75200 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
NPIPB7O75200 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
NPIPB7O75200 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
NPIPB7O75200 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
NPIPB7O75200 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
NPIPB7O75200 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
NPIPB7O75200 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
NPIPB7O75200 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
NPIPB7O75200 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
NPIPB7O75200 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
NPIPB7O75200 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
NPIPB7O75200 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
NPIPB7O75200 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-1.91□□□□□ -2.72
NPIPB7O75200 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
NPIPB7O75200 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.91□□□□□ -2.72
NPIPB7O75200 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
NPIPB7O75200 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
NPIPB7O75200 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
NPIPB7O75200 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
NPIPB7O75200 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
NPIPB7O75200 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
NPIPB7O75200 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
NPIPB7O75200 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
NPIPB7O75200 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
NPIPB7O75200 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
NPIPB7O75200 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
NPIPB7O75200 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
NPIPB7O75200 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
NPIPB7O75200 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
NPIPB7O75200 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
NPIPB7O75200 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
NPIPB7O75200 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
NPIPB7O75200 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
NPIPB7O75200 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
NPIPB7O75200 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
NPIPB7O75200 AC097484.2-201ENST00000509147 251 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
NPIPB7O75200 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
NPIPB7O75200 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
NPIPB7O75200 Y_RNA.722-201ENST00000517279 114 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
NPIPB7O75200 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
NPIPB7O75200 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
NPIPB7O75200 SNORA72.7-201ENST00000516349 94 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
NPIPB7O75200 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
NPIPB7O75200 ZEB2_AS1_4.1-201ENST00000615159 78 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
NPIPB7O75200 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
NPIPB7O75200 RNU6-1324P-201ENST00000384222 107 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
NPIPB7O75200 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
NPIPB7O75200 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
NPIPB7O75200 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
NPIPB7O75200 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
NPIPB7O75200 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
NPIPB7O75200 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
NPIPB7O75200 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
NPIPB7O75200 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
NPIPB7O75200 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
NPIPB7O75200 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
NPIPB7O75200 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
NPIPB7O75200 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
NPIPB7O75200 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
NPIPB7O75200 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
NPIPB7O75200 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
NPIPB7O75200 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
NPIPB7O75200 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
NPIPB7O75200 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
NPIPB7O75200 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
NPIPB7O75200 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
NPIPB7O75200 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
NPIPB7O75200 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
NPIPB7O75200 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-2.16□□□□□ -2.76
NPIPB7O75200 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
NPIPB7O75200 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC-2.19□□□□□ -2.76
NPIPB7O75200 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
NPIPB7O75200 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
NPIPB7O75200 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 233 ms