Protein–RNA interactions for Protein: Q9UII4

HERC5, E3 ISG15--protein ligase HERC5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC5Q9UII4 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
HERC5Q9UII4 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
HERC5Q9UII4 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
HERC5Q9UII4 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
HERC5Q9UII4 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
HERC5Q9UII4 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
HERC5Q9UII4 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
HERC5Q9UII4 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
HERC5Q9UII4 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
HERC5Q9UII4 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
HERC5Q9UII4 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
HERC5Q9UII4 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
HERC5Q9UII4 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
HERC5Q9UII4 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
HERC5Q9UII4 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
HERC5Q9UII4 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
HERC5Q9UII4 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
HERC5Q9UII4 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
HERC5Q9UII4 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-1.17□□□□□ -2.6
HERC5Q9UII4 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
HERC5Q9UII4 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
HERC5Q9UII4 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
HERC5Q9UII4 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-1.18□□□□□ -2.6
HERC5Q9UII4 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
HERC5Q9UII4 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-1.19□□□□□ -2.6
HERC5Q9UII4 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
HERC5Q9UII4 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
HERC5Q9UII4 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-1.2□□□□□ -2.6
HERC5Q9UII4 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
HERC5Q9UII4 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
HERC5Q9UII4 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
HERC5Q9UII4 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
HERC5Q9UII4 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
HERC5Q9UII4 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
HERC5Q9UII4 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
HERC5Q9UII4 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
HERC5Q9UII4 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
HERC5Q9UII4 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
HERC5Q9UII4 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
HERC5Q9UII4 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
HERC5Q9UII4 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
HERC5Q9UII4 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
HERC5Q9UII4 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
HERC5Q9UII4 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
HERC5Q9UII4 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.27□□□□□ -2.61
HERC5Q9UII4 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
HERC5Q9UII4 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
HERC5Q9UII4 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
HERC5Q9UII4 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
HERC5Q9UII4 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
HERC5Q9UII4 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
HERC5Q9UII4 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
HERC5Q9UII4 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
HERC5Q9UII4 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
HERC5Q9UII4 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
HERC5Q9UII4 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
HERC5Q9UII4 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
HERC5Q9UII4 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
HERC5Q9UII4 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
HERC5Q9UII4 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.35□□□□□ -2.63
HERC5Q9UII4 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
HERC5Q9UII4 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.36□□□□□ -2.63
HERC5Q9UII4 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.37□□□□□ -2.63
HERC5Q9UII4 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
HERC5Q9UII4 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
HERC5Q9UII4 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
HERC5Q9UII4 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
HERC5Q9UII4 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
HERC5Q9UII4 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
HERC5Q9UII4 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
HERC5Q9UII4 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
HERC5Q9UII4 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
HERC5Q9UII4 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
HERC5Q9UII4 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
HERC5Q9UII4 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
HERC5Q9UII4 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
HERC5Q9UII4 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
HERC5Q9UII4 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
HERC5Q9UII4 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
HERC5Q9UII4 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
HERC5Q9UII4 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
HERC5Q9UII4 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
HERC5Q9UII4 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
HERC5Q9UII4 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
HERC5Q9UII4 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
HERC5Q9UII4 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
HERC5Q9UII4 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
HERC5Q9UII4 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
HERC5Q9UII4 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
HERC5Q9UII4 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
HERC5Q9UII4 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
HERC5Q9UII4 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
HERC5Q9UII4 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
HERC5Q9UII4 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
HERC5Q9UII4 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
HERC5Q9UII4 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
HERC5Q9UII4 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
HERC5Q9UII4 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
HERC5Q9UII4 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
HERC5Q9UII4 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms