Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CCBE1Q6UXH8 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CCBE1Q6UXH8 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-0.62□□□□□ -2.51
CCBE1Q6UXH8 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CCBE1Q6UXH8 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
CCBE1Q6UXH8 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CCBE1Q6UXH8 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CCBE1Q6UXH8 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.543-201ENST00000384649 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CCBE1Q6UXH8 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CCBE1Q6UXH8 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CCBE1Q6UXH8 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
CCBE1Q6UXH8 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CCBE1Q6UXH8 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CCBE1Q6UXH8 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CCBE1Q6UXH8 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
CCBE1Q6UXH8 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CCBE1Q6UXH8 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CCBE1Q6UXH8 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CCBE1Q6UXH8 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
CCBE1Q6UXH8 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CCBE1Q6UXH8 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CCBE1Q6UXH8 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
CCBE1Q6UXH8 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CCBE1Q6UXH8 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CCBE1Q6UXH8 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
CCBE1Q6UXH8 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
CCBE1Q6UXH8 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
CCBE1Q6UXH8 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CCBE1Q6UXH8 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CCBE1Q6UXH8 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
CCBE1Q6UXH8 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CCBE1Q6UXH8 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CCBE1Q6UXH8 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
CCBE1Q6UXH8 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CCBE1Q6UXH8 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CCBE1Q6UXH8 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CCBE1Q6UXH8 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CCBE1Q6UXH8 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CCBE1Q6UXH8 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CCBE1Q6UXH8 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CCBE1Q6UXH8 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CCBE1Q6UXH8 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CCBE1Q6UXH8 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CCBE1Q6UXH8 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
CCBE1Q6UXH8 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CCBE1Q6UXH8 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CCBE1Q6UXH8 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CCBE1Q6UXH8 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CCBE1Q6UXH8 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CCBE1Q6UXH8 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
CCBE1Q6UXH8 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CCBE1Q6UXH8 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CCBE1Q6UXH8 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CCBE1Q6UXH8 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
CCBE1Q6UXH8 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CCBE1Q6UXH8 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CCBE1Q6UXH8 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
CCBE1Q6UXH8 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CCBE1Q6UXH8 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CCBE1Q6UXH8 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
CCBE1Q6UXH8 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CCBE1Q6UXH8 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CCBE1Q6UXH8 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CCBE1Q6UXH8 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.365-201ENST00000365537 102 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
CCBE1Q6UXH8 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CCBE1Q6UXH8 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CCBE1Q6UXH8 RNU6-1121P-201ENST00000516802 109 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CCBE1Q6UXH8 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CCBE1Q6UXH8 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CCBE1Q6UXH8 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
CCBE1Q6UXH8 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CCBE1Q6UXH8 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CCBE1Q6UXH8 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CCBE1Q6UXH8 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CCBE1Q6UXH8 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CCBE1Q6UXH8 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CCBE1Q6UXH8 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CCBE1Q6UXH8 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CCBE1Q6UXH8 RNU7-119P-201ENST00000459279 63 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CCBE1Q6UXH8 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CCBE1Q6UXH8 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CCBE1Q6UXH8 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CCBE1Q6UXH8 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 297.2 ms