Protein–RNA interactions for Protein: Q15465

SHH, Sonic hedgehog protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHHQ15465 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SHHQ15465 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SHHQ15465 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SHHQ15465 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SHHQ15465 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SHHQ15465 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SHHQ15465 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SHHQ15465 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SHHQ15465 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SHHQ15465 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SHHQ15465 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SHHQ15465 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
SHHQ15465 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SHHQ15465 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SHHQ15465 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SHHQ15465 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SHHQ15465 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SHHQ15465 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SHHQ15465 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SHHQ15465 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SHHQ15465 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SHHQ15465 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SHHQ15465 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SHHQ15465 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SHHQ15465 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SHHQ15465 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SHHQ15465 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SHHQ15465 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SHHQ15465 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SHHQ15465 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SHHQ15465 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SHHQ15465 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SHHQ15465 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
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SHHQ15465 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SHHQ15465 TRGJP-201ENST00000390338 61 ntAPPRIS P1 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
SHHQ15465 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SHHQ15465 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SHHQ15465 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SHHQ15465 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SHHQ15465 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SHHQ15465 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SHHQ15465 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SHHQ15465 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SHHQ15465 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SHHQ15465 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
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SHHQ15465 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
SHHQ15465 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
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SHHQ15465 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
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SHHQ15465 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SHHQ15465 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SHHQ15465 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
SHHQ15465 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SHHQ15465 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
SHHQ15465 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SHHQ15465 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
SHHQ15465 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
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