Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
SMAD4Q13485 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMAD4Q13485 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
SMAD4Q13485 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMAD4Q13485 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMAD4Q13485 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMAD4Q13485 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
SMAD4Q13485 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMAD4Q13485 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMAD4Q13485 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMAD4Q13485 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMAD4Q13485 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMAD4Q13485 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMAD4Q13485 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SMAD4Q13485 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SMAD4Q13485 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SMAD4Q13485 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SMAD4Q13485 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SMAD4Q13485 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SMAD4Q13485 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMAD4Q13485 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SMAD4Q13485 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SMAD4Q13485 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SMAD4Q13485 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SMAD4Q13485 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
SMAD4Q13485 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMAD4Q13485 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
SMAD4Q13485 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMAD4Q13485 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
SMAD4Q13485 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMAD4Q13485 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMAD4Q13485 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
SMAD4Q13485 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMAD4Q13485 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMAD4Q13485 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
SMAD4Q13485 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
SMAD4Q13485 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMAD4Q13485 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
SMAD4Q13485 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SMAD4Q13485 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SMAD4Q13485 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
SMAD4Q13485 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
SMAD4Q13485 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SMAD4Q13485 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SMAD4Q13485 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SMAD4Q13485 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMAD4Q13485 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SMAD4Q13485 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMAD4Q13485 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SMAD4Q13485 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SMAD4Q13485 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SMAD4Q13485 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SMAD4Q13485 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SMAD4Q13485 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SMAD4Q13485 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SMAD4Q13485 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SMAD4Q13485 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SMAD4Q13485 MIR548H4-201ENST00000408689 111 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SMAD4Q13485 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SMAD4Q13485 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SMAD4Q13485 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SMAD4Q13485 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SMAD4Q13485 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SMAD4Q13485 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SMAD4Q13485 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SMAD4Q13485 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SMAD4Q13485 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SMAD4Q13485 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SMAD4Q13485 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.48□□□□□ -2.49
SMAD4Q13485 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
SMAD4Q13485 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SMAD4Q13485 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
SMAD4Q13485 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMAD4Q13485 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SMAD4Q13485 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.53□□□□□ -2.49
SMAD4Q13485 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMAD4Q13485 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMAD4Q13485 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMAD4Q13485 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMAD4Q13485 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
SMAD4Q13485 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SMAD4Q13485 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SMAD4Q13485 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
SMAD4Q13485 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SMAD4Q13485 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
SMAD4Q13485 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SMAD4Q13485 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SMAD4Q13485 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMAD4Q13485 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-0.59□□□□□ -2.5
SMAD4Q13485 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SMAD4Q13485 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SMAD4Q13485 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
SMAD4Q13485 RNU6-1008P-201ENST00000384160 104 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SMAD4Q13485 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
SMAD4Q13485 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMAD4Q13485 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMAD4Q13485 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
SMAD4Q13485 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.63□□□□□ -2.51
SMAD4Q13485 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
SMAD4Q13485 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 289.4 ms