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Protein–RNA interactions for Protein: Q13296
SCGB2A2, Mammaglobin-A, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
SCGB2A2
Q13296
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111 nt
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□□□□□ -2.87
SCGB2A2
Q13296
Y_RNA.502-201
ENST00000384478
113 nt
BASIC
-2.85
□□□□□ -2.87
SCGB2A2
Q13296
RNU6-1241P-201
ENST00000384536
107 nt
BASIC
-2.85
□□□□□ -2.87
SCGB2A2
Q13296
MIR154-201
ENST00000385243
84 nt
BASIC
-2.85
□□□□□ -2.87
SCGB2A2
Q13296
Y_RNA.593-201
ENST00000410292
98 nt
BASIC
-2.85
□□□□□ -2.87
SCGB2A2
Q13296
ST7-OT3_1.1-201
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74 nt
BASIC
-2.85
□□□□□ -2.87
SCGB2A2
Q13296
Y_RNA.781-201
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BASIC
-2.85
□□□□□ -2.87
SCGB2A2
Q13296
Y_RNA.186-201
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BASIC
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□□□□□ -2.87
SCGB2A2
Q13296
RNU6-258P-201
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-2.86
□□□□□ -2.87
SCGB2A2
Q13296
Y_RNA.629-201
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105 nt
BASIC
-2.86
□□□□□ -2.87
SCGB2A2
Q13296
MIR3910-1-201
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111 nt
BASIC
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□□□□□ -2.87
SCGB2A2
Q13296
MIR5588-201
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BASIC
-2.86
□□□□□ -2.87
SCGB2A2
Q13296
Y_RNA.103-201
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102 nt
BASIC
-2.87
□□□□□ -2.87
SCGB2A2
Q13296
Y_RNA.313-201
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103 nt
BASIC
-2.88
□□□□□ -2.87
SCGB2A2
Q13296
MIR579-201
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98 nt
BASIC
-2.88
□□□□□ -2.87
SCGB2A2
Q13296
RNU6-70P-201
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60 nt
BASIC
-2.88
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SCGB2A2
Q13296
LINC01984-201
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301 nt
TSL 3
BASIC
-2.88
□□□□□ -2.87
SCGB2A2
Q13296
RNU6-172P-201
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□□□□□ -2.87
SCGB2A2
Q13296
SNORD63.2-201
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64 nt
BASIC
-2.89
□□□□□ -2.87
SCGB2A2
Q13296
SNORA27.2-201
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126 nt
BASIC
-2.9
□□□□□ -2.87
SCGB2A2
Q13296
RNA5SP405-201
ENST00000363059
114 nt
BASIC
-2.92
□□□□□ -2.88
SCGB2A2
Q13296
RNU6-1131P-201
ENST00000364955
107 nt
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-2.92
□□□□□ -2.88
SCGB2A2
Q13296
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107 nt
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SCGB2A2
Q13296
RNU6-979P-201
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107 nt
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-2.93
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SCGB2A2
Q13296
RNU6-789P-201
ENST00000517105
102 nt
BASIC
-2.93
□□□□□ -2.88
SCGB2A2
Q13296
MIR3123-201
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75 nt
BASIC
-2.94
□□□□□ -2.88
SCGB2A2
Q13296
SNORD116-24-201
ENST00000384549
92 nt
BASIC
-2.95
□□□□□ -2.88
SCGB2A2
Q13296
RNU6-919P-201
ENST00000516731
104 nt
BASIC
-2.96
□□□□□ -2.88
SCGB2A2
Q13296
MIR4712-201
ENST00000583750
82 nt
BASIC
-2.96
□□□□□ -2.88
SCGB2A2
Q13296
MTRNR2L9-201
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75 nt
BASIC
-2.96
□□□□□ -2.88
SCGB2A2
Q13296
MIR7978-201
ENST00000636158
59 nt
BASIC
-2.96
□□□□□ -2.88
SCGB2A2
Q13296
RNU6-841P-201
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107 nt
BASIC
-2.97
□□□□□ -2.88
SCGB2A2
Q13296
RNU6-1034P-201
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Q13296
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107 nt
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SCGB2A2
Q13296
MIR1245B-201
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Q13296
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Q13296
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Q13296
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Q13296
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Q13296
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Q13296
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Q13296
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ENST00000626210
201 nt
TSL 5
BASIC
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Q13296
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Q13296
SNORD115-31-201
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Q13296
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Q13296
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Q13296
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Q13296
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Q13296
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Q13296
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Q13296
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Q13296
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Q13296
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BASIC
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Q13296
RNU6-1079P-201
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Q13296
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BASIC
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Q13296
CR2-207
ENST00000640301
151 nt
TSL 1 (best)
BASIC
-3.08
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SCGB2A2
Q13296
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Q13296
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Q13296
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Q13296
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SCGB2A2
Q13296
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SCGB2A2
Q13296
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SCGB2A2
Q13296
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SCGB2A2
Q13296
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SCGB2A2
Q13296
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SCGB2A2
Q13296
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Q13296
MIR7110-201
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SCGB2A2
Q13296
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SCGB2A2
Q13296
RNU6-687P-201
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BASIC
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SCGB2A2
Q13296
MIR494-201
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BASIC
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□□□□□ -2.91
SCGB2A2
Q13296
RNU6-44P-201
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107 nt
BASIC
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Q13296
RNU6-828P-201
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SCGB2A2
Q13296
SNORD60.1-201
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73 nt
BASIC
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SCGB2A2
Q13296
Y_RNA.69-201
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□□□□□ -2.92
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Q13296
RNU6-1276P-201
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104 nt
BASIC
-3.16
□□□□□ -2.92
SCGB2A2
Q13296
Y_RNA.443-201
ENST00000384135
111 nt
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-3.17
□□□□□ -2.92
SCGB2A2
Q13296
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104 nt
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SCGB2A2
Q13296
RNU6-411P-201
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107 nt
BASIC
-3.18
□□□□□ -2.92
SCGB2A2
Q13296
SNORD18C-201
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BASIC
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SCGB2A2
Q13296
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100 nt
BASIC
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□□□□□ -2.92
SCGB2A2
Q13296
MIR4666B-201
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BASIC
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SCGB2A2
Q13296
RNU6-810P-201
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BASIC
-3.21
□□□□□ -2.92
SCGB2A2
Q13296
RNU6-231P-201
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103 nt
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□□□□□ -2.92
SCGB2A2
Q13296
SNORD60-201
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83 nt
BASIC
-3.22
□□□□□ -2.92
SCGB2A2
Q13296
SNORD116.2-201
ENST00000391251
93 nt
BASIC
-3.22
□□□□□ -2.92
SCGB2A2
Q13296
AL078612.1-201
ENST00000533009
150 nt
TSL 5
BASIC
-3.23
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SCGB2A2
Q13296
RNU6-230P-201
ENST00000362457
104 nt
BASIC
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SCGB2A2
Q13296
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Q13296
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107 nt
BASIC
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Q13296
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71 nt
BASIC
-3.26
□□□□□ -2.93
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Q13296
RNU6-1015P-201
ENST00000517121
99 nt
BASIC
-3.26
□□□□□ -2.93
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Q13296
MIR202-201
ENST00000362219
110 nt
BASIC
-3.27
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Q13296
U7.4-201
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63 nt
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-3.28
□□□□□ -2.93
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Q13296
RNU6-294P-201
ENST00000364999
102 nt
BASIC
-3.3
□□□□□ -2.94
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