Protein–RNA interactions for Protein: P53611

RABGGTB, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTBP53611 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
RABGGTBP53611 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
RABGGTBP53611 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
RABGGTBP53611 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
RABGGTBP53611 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
RABGGTBP53611 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
RABGGTBP53611 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
RABGGTBP53611 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
RABGGTBP53611 SNORD126-201ENST00000459475 77 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
RABGGTBP53611 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
RABGGTBP53611 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
RABGGTBP53611 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
RABGGTBP53611 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
RABGGTBP53611 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
RABGGTBP53611 RNU4-33P-201ENST00000364316 85 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
RABGGTBP53611 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
RABGGTBP53611 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
RABGGTBP53611 MIR196A2-201ENST00000385189 110 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
RABGGTBP53611 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
RABGGTBP53611 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
RABGGTBP53611 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
RABGGTBP53611 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
RABGGTBP53611 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
RABGGTBP53611 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
RABGGTBP53611 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
RABGGTBP53611 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
RABGGTBP53611 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
RABGGTBP53611 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
RABGGTBP53611 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
RABGGTBP53611 Y_RNA.379-201ENST00000365653 102 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
RABGGTBP53611 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
RABGGTBP53611 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
RABGGTBP53611 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
RABGGTBP53611 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
RABGGTBP53611 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
RABGGTBP53611 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
RABGGTBP53611 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
RABGGTBP53611 RNU6-753P-201ENST00000363926 107 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RABGGTBP53611 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RABGGTBP53611 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RABGGTBP53611 MIR147A-201ENST00000385079 72 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RABGGTBP53611 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
RABGGTBP53611 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.54□□□□□ -2.5
RABGGTBP53611 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-0.55□□□□□ -2.5
RABGGTBP53611 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
RABGGTBP53611 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-0.56□□□□□ -2.5
RABGGTBP53611 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
RABGGTBP53611 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
RABGGTBP53611 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
RABGGTBP53611 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
RABGGTBP53611 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-0.57□□□□□ -2.5
RABGGTBP53611 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
RABGGTBP53611 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
RABGGTBP53611 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.6□□□□□ -2.51
RABGGTBP53611 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
RABGGTBP53611 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
RABGGTBP53611 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
RABGGTBP53611 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.61□□□□□ -2.51
RABGGTBP53611 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-0.61□□□□□ -2.51
RABGGTBP53611 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
RABGGTBP53611 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
RABGGTBP53611 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-0.62□□□□□ -2.51
RABGGTBP53611 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
RABGGTBP53611 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
RABGGTBP53611 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.64□□□□□ -2.51
RABGGTBP53611 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
RABGGTBP53611 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
RABGGTBP53611 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
RABGGTBP53611 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
RABGGTBP53611 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
RABGGTBP53611 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
RABGGTBP53611 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
RABGGTBP53611 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
RABGGTBP53611 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
RABGGTBP53611 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
RABGGTBP53611 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
RABGGTBP53611 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
RABGGTBP53611 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
RABGGTBP53611 RNU6-1204P-201ENST00000363948 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RABGGTBP53611 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RABGGTBP53611 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RABGGTBP53611 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
RABGGTBP53611 AL500527.2-201ENST00000454105 95 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
RABGGTBP53611 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
RABGGTBP53611 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
RABGGTBP53611 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
RABGGTBP53611 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
RABGGTBP53611 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.76□□□□□ -2.53
RABGGTBP53611 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
RABGGTBP53611 RNU6-176P-201ENST00000517196 105 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
RABGGTBP53611 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
RABGGTBP53611 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
RABGGTBP53611 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
RABGGTBP53611 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
RABGGTBP53611 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
RABGGTBP53611 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
RABGGTBP53611 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
RABGGTBP53611 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
RABGGTBP53611 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
RABGGTBP53611 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 178.9 ms