Protein–RNA interactions for Protein: P18615

NELFE, Negative elongation factor E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFEP18615 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
NELFEP18615 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
NELFEP18615 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
NELFEP18615 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
NELFEP18615 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
NELFEP18615 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
NELFEP18615 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
NELFEP18615 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
NELFEP18615 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
NELFEP18615 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
NELFEP18615 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
NELFEP18615 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
NELFEP18615 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
NELFEP18615 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
NELFEP18615 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
NELFEP18615 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
NELFEP18615 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
NELFEP18615 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
NELFEP18615 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
NELFEP18615 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
NELFEP18615 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
NELFEP18615 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
NELFEP18615 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
NELFEP18615 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
NELFEP18615 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
NELFEP18615 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
NELFEP18615 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
NELFEP18615 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
NELFEP18615 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
NELFEP18615 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
NELFEP18615 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
NELFEP18615 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
NELFEP18615 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
NELFEP18615 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-2.16□□□□□ -2.76
NELFEP18615 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
NELFEP18615 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
NELFEP18615 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
NELFEP18615 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
NELFEP18615 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
NELFEP18615 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
NELFEP18615 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
NELFEP18615 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
NELFEP18615 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
NELFEP18615 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
NELFEP18615 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
NELFEP18615 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
NELFEP18615 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
NELFEP18615 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
NELFEP18615 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
NELFEP18615 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-2.19□□□□□ -2.76
NELFEP18615 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
NELFEP18615 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
NELFEP18615 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
NELFEP18615 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
NELFEP18615 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
NELFEP18615 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
NELFEP18615 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
NELFEP18615 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
NELFEP18615 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
NELFEP18615 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
NELFEP18615 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
NELFEP18615 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
NELFEP18615 SNORD18C-201ENST00000362704 69 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
NELFEP18615 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
NELFEP18615 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
NELFEP18615 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
NELFEP18615 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
NELFEP18615 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
NELFEP18615 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
NELFEP18615 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
NELFEP18615 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
NELFEP18615 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
NELFEP18615 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-2.27□□□□□ -2.77
NELFEP18615 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC-2.27□□□□□ -2.77
NELFEP18615 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
NELFEP18615 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
NELFEP18615 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.28□□□□□ -2.77
NELFEP18615 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
NELFEP18615 MT-TM-201ENST00000387377 68 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
NELFEP18615 RNU6ATAC17P-201ENST00000516074 71 ntBASIC-2.29□□□□□ -2.78
NELFEP18615 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
NELFEP18615 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
NELFEP18615 U7.4-201ENST00000614961 63 ntBASIC-2.3□□□□□ -2.78
NELFEP18615 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
NELFEP18615 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
NELFEP18615 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
NELFEP18615 RNU6-194P-201ENST00000363862 105 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
NELFEP18615 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
NELFEP18615 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
NELFEP18615 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
NELFEP18615 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
NELFEP18615 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
NELFEP18615 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
NELFEP18615 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
NELFEP18615 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
NELFEP18615 RNY4P7-201ENST00000364600 96 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
NELFEP18615 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
NELFEP18615 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
NELFEP18615 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
NELFEP18615 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
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