Protein–RNA interactions for Protein: Q16560

SNRNP35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP35Q16560 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SNRNP35Q16560 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SNRNP35Q16560 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SNRNP35Q16560 Y_RNA.204-201ENST00000364112 102 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SNRNP35Q16560 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SNRNP35Q16560 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SNRNP35Q16560 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SNRNP35Q16560 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SNRNP35Q16560 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SNRNP35Q16560 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SNRNP35Q16560 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SNRNP35Q16560 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SNRNP35Q16560 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SNRNP35Q16560 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SNRNP35Q16560 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SNRNP35Q16560 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SNRNP35Q16560 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SNRNP35Q16560 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SNRNP35Q16560 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SNRNP35Q16560 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SNRNP35Q16560 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SNRNP35Q16560 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SNRNP35Q16560 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SNRNP35Q16560 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SNRNP35Q16560 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SNRNP35Q16560 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SNRNP35Q16560 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SNRNP35Q16560 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SNRNP35Q16560 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SNRNP35Q16560 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SNRNP35Q16560 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SNRNP35Q16560 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SNRNP35Q16560 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SNRNP35Q16560 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SNRNP35Q16560 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SNRNP35Q16560 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SNRNP35Q16560 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
SNRNP35Q16560 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SNRNP35Q16560 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.65□□□□□ -2.67
SNRNP35Q16560 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SNRNP35Q16560 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
SNRNP35Q16560 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SNRNP35Q16560 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
SNRNP35Q16560 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SNRNP35Q16560 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SNRNP35Q16560 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SNRNP35Q16560 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
SNRNP35Q16560 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SNRNP35Q16560 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SNRNP35Q16560 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SNRNP35Q16560 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
SNRNP35Q16560 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SNRNP35Q16560 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SNRNP35Q16560 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
SNRNP35Q16560 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SNRNP35Q16560 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SNRNP35Q16560 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SNRNP35Q16560 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SNRNP35Q16560 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
SNRNP35Q16560 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SNRNP35Q16560 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SNRNP35Q16560 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SNRNP35Q16560 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SNRNP35Q16560 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SNRNP35Q16560 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SNRNP35Q16560 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
SNRNP35Q16560 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SNRNP35Q16560 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SNRNP35Q16560 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
SNRNP35Q16560 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SNRNP35Q16560 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
SNRNP35Q16560 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SNRNP35Q16560 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SNRNP35Q16560 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SNRNP35Q16560 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SNRNP35Q16560 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
SNRNP35Q16560 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SNRNP35Q16560 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SNRNP35Q16560 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
SNRNP35Q16560 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SNRNP35Q16560 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
SNRNP35Q16560 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SNRNP35Q16560 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SNRNP35Q16560 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SNRNP35Q16560 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
SNRNP35Q16560 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SNRNP35Q16560 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
SNRNP35Q16560 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SNRNP35Q16560 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SNRNP35Q16560 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SNRNP35Q16560 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SNRNP35Q16560 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
SNRNP35Q16560 Y_RNA.53-201ENST00000362765 102 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
SNRNP35Q16560 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
SNRNP35Q16560 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
SNRNP35Q16560 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
SNRNP35Q16560 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
SNRNP35Q16560 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
SNRNP35Q16560 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
SNRNP35Q16560 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
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