Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PKN1Q16512 SNORD111B-201ENST00000408587 80 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PKN1Q16512 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PKN1Q16512 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PKN1Q16512 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PKN1Q16512 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
PKN1Q16512 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PKN1Q16512 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
PKN1Q16512 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PKN1Q16512 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PKN1Q16512 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PKN1Q16512 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PKN1Q16512 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PKN1Q16512 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PKN1Q16512 MIR4426-201ENST00000640330 63 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
PKN1Q16512 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PKN1Q16512 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PKN1Q16512 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PKN1Q16512 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PKN1Q16512 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
PKN1Q16512 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PKN1Q16512 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PKN1Q16512 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
PKN1Q16512 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PKN1Q16512 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PKN1Q16512 SNORA50A-201ENST00000384225 134 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PKN1Q16512 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PKN1Q16512 RNU6-894P-201ENST00000517094 105 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PKN1Q16512 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PKN1Q16512 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
PKN1Q16512 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PKN1Q16512 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PKN1Q16512 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PKN1Q16512 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PKN1Q16512 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
PKN1Q16512 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
PKN1Q16512 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
PKN1Q16512 RNU6-485P-201ENST00000363475 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PKN1Q16512 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
PKN1Q16512 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PKN1Q16512 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PKN1Q16512 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
PKN1Q16512 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PKN1Q16512 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PKN1Q16512 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PKN1Q16512 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PKN1Q16512 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
PKN1Q16512 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PKN1Q16512 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PKN1Q16512 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PKN1Q16512 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
PKN1Q16512 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PKN1Q16512 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
PKN1Q16512 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
PKN1Q16512 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PKN1Q16512 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
PKN1Q16512 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PKN1Q16512 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
PKN1Q16512 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
PKN1Q16512 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PKN1Q16512 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PKN1Q16512 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PKN1Q16512 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PKN1Q16512 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PKN1Q16512 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
PKN1Q16512 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
PKN1Q16512 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PKN1Q16512 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PKN1Q16512 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC0.44□□□□□ -2.34
PKN1Q16512 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PKN1Q16512 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0.43□□□□□ -2.34
PKN1Q16512 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PKN1Q16512 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PKN1Q16512 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC0.42□□□□□ -2.34
PKN1Q16512 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PKN1Q16512 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PKN1Q16512 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC0.41□□□□□ -2.34
PKN1Q16512 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC0.4□□□□□ -2.35
PKN1Q16512 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PKN1Q16512 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PKN1Q16512 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PKN1Q16512 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC0.39□□□□□ -2.35
PKN1Q16512 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PKN1Q16512 Y_RNA.382-201ENST00000365672 114 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PKN1Q16512 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PKN1Q16512 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PKN1Q16512 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
PKN1Q16512 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PKN1Q16512 RNU6-133P-201ENST00000383989 107 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
PKN1Q16512 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PKN1Q16512 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
PKN1Q16512 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PKN1Q16512 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PKN1Q16512 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PKN1Q16512 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PKN1Q16512 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PKN1Q16512 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
PKN1Q16512 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PKN1Q16512 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
PKN1Q16512 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
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