Protein–RNA interactions for Protein: Q13905

RAPGEF1, Rap guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,077 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF1Q13905 MIR548X-201ENST00000580069 75 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RAPGEF1Q13905 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
RAPGEF1Q13905 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RAPGEF1Q13905 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RAPGEF1Q13905 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
RAPGEF1Q13905 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RAPGEF1Q13905 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
RAPGEF1Q13905 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RAPGEF1Q13905 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RAPGEF1Q13905 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RAPGEF1Q13905 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RAPGEF1Q13905 RNU6-419P-201ENST00000517030 63 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RAPGEF1Q13905 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
RAPGEF1Q13905 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC0.1□□□□□ -2.39
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RAPGEF1Q13905 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RAPGEF1Q13905 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RAPGEF1Q13905 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RAPGEF1Q13905 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
RAPGEF1Q13905 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RAPGEF1Q13905 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RAPGEF1Q13905 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RAPGEF1Q13905 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
RAPGEF1Q13905 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RAPGEF1Q13905 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
RAPGEF1Q13905 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RAPGEF1Q13905 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RAPGEF1Q13905 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
RAPGEF1Q13905 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RAPGEF1Q13905 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.05□□□□□ -2.4
RAPGEF1Q13905 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RAPGEF1Q13905 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RAPGEF1Q13905 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RAPGEF1Q13905 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RAPGEF1Q13905 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
RAPGEF1Q13905 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
RAPGEF1Q13905 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
RAPGEF1Q13905 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
RAPGEF1Q13905 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
RAPGEF1Q13905 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
RAPGEF1Q13905 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
RAPGEF1Q13905 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
RAPGEF1Q13905 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
RAPGEF1Q13905 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
RAPGEF1Q13905 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
RAPGEF1Q13905 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
RAPGEF1Q13905 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
RAPGEF1Q13905 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
RAPGEF1Q13905 DLEU2_4.2-201ENST00000616613 58 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
RAPGEF1Q13905 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0□□□□□ -2.41
RAPGEF1Q13905 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC0□□□□□ -2.41
RAPGEF1Q13905 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC0□□□□□ -2.41
RAPGEF1Q13905 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC0□□□□□ -2.41
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
RAPGEF1Q13905 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
RAPGEF1Q13905 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
RAPGEF1Q13905 RNU6-838P-201ENST00000363399 108 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RAPGEF1Q13905 MIR29B1-201ENST00000385015 81 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RAPGEF1Q13905 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RAPGEF1Q13905 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
RAPGEF1Q13905 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RAPGEF1Q13905 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RAPGEF1Q13905 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RAPGEF1Q13905 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
RAPGEF1Q13905 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RAPGEF1Q13905 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RAPGEF1Q13905 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RAPGEF1Q13905 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RAPGEF1Q13905 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
RAPGEF1Q13905 RNU6-986P-201ENST00000363133 102 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RAPGEF1Q13905 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RAPGEF1Q13905 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RAPGEF1Q13905 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RAPGEF1Q13905 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RAPGEF1Q13905 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RAPGEF1Q13905 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RAPGEF1Q13905 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RAPGEF1Q13905 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RAPGEF1Q13905 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RAPGEF1Q13905 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RAPGEF1Q13905 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RAPGEF1Q13905 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RAPGEF1Q13905 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RAPGEF1Q13905 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RAPGEF1Q13905 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RAPGEF1Q13905 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RAPGEF1Q13905 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RAPGEF1Q13905 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RAPGEF1Q13905 MIR548AL-201ENST00000578416 97 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RAPGEF1Q13905 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
RAPGEF1Q13905 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
RAPGEF1Q13905 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
RAPGEF1Q13905 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
RAPGEF1Q13905 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
RAPGEF1Q13905 Y_RNA.321-201ENST00000365149 102 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
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