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Protein–RNA interactions for Protein: Q13634
CDH18, Cadherin-18, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
CDH18
Q13634
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□□□□□ -2.57
CDH18
Q13634
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111 nt
BASIC
-0.99
□□□□□ -2.57
CDH18
Q13634
SNORD114-15-201
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72 nt
BASIC
-0.99
□□□□□ -2.57
CDH18
Q13634
SNORD115-31-201
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82 nt
BASIC
-0.99
□□□□□ -2.57
CDH18
Q13634
SNORD116-24-201
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92 nt
BASIC
-0.99
□□□□□ -2.57
CDH18
Q13634
MIR630-201
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97 nt
BASIC
-0.99
□□□□□ -2.57
CDH18
Q13634
MIR527-201
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BASIC
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CDH18
Q13634
SNORA26.2-201
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□□□□□ -2.57
CDH18
Q13634
RNU6-687P-201
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CDH18
Q13634
MIR3202-2-201
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BASIC
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□□□□□ -2.57
CDH18
Q13634
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CDH18
Q13634
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BASIC
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CDH18
Q13634
RNU6-1174P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.57
CDH18
Q13634
MIR6738-201
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BASIC
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CDH18
Q13634
RNA5SP173-201
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BASIC
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CDH18
Q13634
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BASIC
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CDH18
Q13634
HAR1A.1-201
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CDH18
Q13634
Y_RNA.109-201
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BASIC
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□□□□□ -2.57
CDH18
Q13634
Y_RNA.375-201
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101 nt
BASIC
-1.03
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CDH18
Q13634
SNORD19-201
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BASIC
-1.03
□□□□□ -2.57
CDH18
Q13634
AL353691.2-201
ENST00000443795
59 nt
BASIC
-1.03
□□□□□ -2.57
CDH18
Q13634
MIR548AX-201
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BASIC
-1.03
□□□□□ -2.57
CDH18
Q13634
U7.4-201
ENST00000614961
63 nt
BASIC
-1.03
□□□□□ -2.57
CDH18
Q13634
MIR429-201
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83 nt
BASIC
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CDH18
Q13634
RNU6-411P-201
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BASIC
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CDH18
Q13634
SNORD113-2-201
ENST00000391082
72 nt
BASIC
-1.04
□□□□□ -2.58
CDH18
Q13634
RNY1P9-201
ENST00000532431
109 nt
BASIC
-1.04
□□□□□ -2.58
CDH18
Q13634
RNU6-228P-201
ENST00000362700
106 nt
BASIC
-1.05
□□□□□ -2.58
CDH18
Q13634
RNU6-1124P-201
ENST00000384169
107 nt
BASIC
-1.05
□□□□□ -2.58
CDH18
Q13634
RNU6-24P-201
ENST00000384440
107 nt
BASIC
-1.05
□□□□□ -2.58
CDH18
Q13634
MIR4306-201
ENST00000583390
91 nt
BASIC
-1.05
□□□□□ -2.58
CDH18
Q13634
Y_RNA.365-201
ENST00000365537
102 nt
BASIC
-1.06
□□□□□ -2.58
CDH18
Q13634
RNU6-30P-201
ENST00000384561
107 nt
BASIC
-1.06
□□□□□ -2.58
CDH18
Q13634
RNU6-696P-201
ENST00000390834
107 nt
BASIC
-1.06
□□□□□ -2.58
CDH18
Q13634
MIR889-201
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79 nt
BASIC
-1.06
□□□□□ -2.58
CDH18
Q13634
RNU6-1015P-201
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BASIC
-1.06
□□□□□ -2.58
CDH18
Q13634
AP002795.1-201
ENST00000534879
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BASIC
-1.06
□□□□□ -2.58
CDH18
Q13634
RNU6-1262P-201
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96 nt
BASIC
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□□□□□ -2.58
CDH18
Q13634
MIR1255A-201
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113 nt
BASIC
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CDH18
Q13634
snoU13.19-201
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Q13634
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Q13634
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BASIC
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CDH18
Q13634
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92 nt
BASIC
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Q13634
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110 nt
BASIC
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CDH18
Q13634
MIR6874-201
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BASIC
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CDH18
Q13634
RNA5SP26-201
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BASIC
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CDH18
Q13634
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CDH18
Q13634
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BASIC
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CDH18
Q13634
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CDH18
Q13634
MIR5683-201
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BASIC
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CDH18
Q13634
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CDH18
Q13634
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CDH18
Q13634
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BASIC
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CDH18
Q13634
MIR3115-201
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BASIC
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CDH18
Q13634
MIR29B1-201
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BASIC
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CDH18
Q13634
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CDH18
Q13634
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CDH18
Q13634
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CDH18
Q13634
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CDH18
Q13634
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CDH18
Q13634
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BASIC
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CDH18
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CDH18
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BASIC
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CDH18
Q13634
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BASIC
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CDH18
Q13634
U2.18-201
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CDH18
Q13634
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BASIC
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CDH18
Q13634
RNU6-540P-201
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101 nt
BASIC
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CDH18
Q13634
MIR3165-201
ENST00000579874
75 nt
BASIC
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□□□□□ -2.59
CDH18
Q13634
Y_RNA.545-201
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BASIC
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CDH18
Q13634
ULK3-223
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126 nt
TSL 5
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CDH18
Q13634
RNU6-226P-201
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107 nt
BASIC
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CDH18
Q13634
HLA-S-202
ENST00000425174
53 nt
BASIC
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□□□□□ -2.6
CDH18
Q13634
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84 nt
BASIC
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□□□□□ -2.6
CDH18
Q13634
Y_RNA.443-201
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111 nt
BASIC
-1.18
□□□□□ -2.6
CDH18
Q13634
RNU6-663P-201
ENST00000391105
106 nt
BASIC
-1.18
□□□□□ -2.6
CDH18
Q13634
RNA5SP225-201
ENST00000410874
135 nt
BASIC
-1.18
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CDH18
Q13634
TRAJ9-201
ENST00000390528
61 nt
APPRIS P1
BASIC
-1.2
□□□□□ -2.6
CDH18
Q13634
RNU6-630P-201
ENST00000391258
106 nt
BASIC
-1.2
□□□□□ -2.6
CDH18
Q13634
RNA5SP67-201
ENST00000516422
131 nt
BASIC
-1.2
□□□□□ -2.6
CDH18
Q13634
MIR5591-201
ENST00000578248
65 nt
BASIC
-1.2
□□□□□ -2.6
CDH18
Q13634
RNU6-92P-201
ENST00000605893
104 nt
BASIC
-1.21
□□□□□ -2.6
CDH18
Q13634
MIR548AA1-201
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97 nt
BASIC
-1.22
□□□□□ -2.6
CDH18
Q13634
AC090616.4-201
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115 nt
BASIC
-1.22
□□□□□ -2.6
CDH18
Q13634
MIR6502-201
ENST00000617296
76 nt
BASIC
-1.22
□□□□□ -2.6
CDH18
Q13634
RNU6-164P-201
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103 nt
BASIC
-1.23
□□□□□ -2.61
CDH18
Q13634
MIR587-201
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96 nt
BASIC
-1.23
□□□□□ -2.61
CDH18
Q13634
AC138207.3-201
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166 nt
BASIC
-1.23
□□□□□ -2.61
CDH18
Q13634
MIR520D-201
ENST00000385002
87 nt
BASIC
-1.24
□□□□□ -2.61
CDH18
Q13634
RNU6-1267P-201
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107 nt
BASIC
-1.24
□□□□□ -2.61
CDH18
Q13634
RNU6-871P-201
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100 nt
BASIC
-1.24
□□□□□ -2.61
CDH18
Q13634
SPRY4-IT1_2.1-201
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121 nt
BASIC
-1.24
□□□□□ -2.61
CDH18
Q13634
SNORD30.1-201
ENST00000391309
70 nt
BASIC
-1.25
□□□□□ -2.61
CDH18
Q13634
SNORA25.4-201
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124 nt
BASIC
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□□□□□ -2.61
CDH18
Q13634
SNORD60.1-201
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73 nt
BASIC
-1.27
□□□□□ -2.61
CDH18
Q13634
RNU6-608P-201
ENST00000383927
104 nt
BASIC
-1.27
□□□□□ -2.61
CDH18
Q13634
MIR3170-201
ENST00000582699
77 nt
BASIC
-1.27
□□□□□ -2.61
CDH18
Q13634
MIR487B-201
ENST00000385021
84 nt
BASIC
-1.28
□□□□□ -2.61
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