Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

Predictions only

Length 2,485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 Y_RNA.579-201ENST00000390939 94 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC-1.72□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
PTPN13Q12923 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
PTPN13Q12923 Y_RNA.320-201ENST00000365144 102 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
PTPN13Q12923 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
PTPN13Q12923 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
PTPN13Q12923 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
PTPN13Q12923 SNORD60-201ENST00000383903 83 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
PTPN13Q12923 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
PTPN13Q12923 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PTPN13Q12923 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PTPN13Q12923 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PTPN13Q12923 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PTPN13Q12923 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PTPN13Q12923 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
PTPN13Q12923 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
PTPN13Q12923 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
PTPN13Q12923 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
PTPN13Q12923 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
PTPN13Q12923 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
PTPN13Q12923 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
PTPN13Q12923 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PTPN13Q12923 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PTPN13Q12923 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PTPN13Q12923 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PTPN13Q12923 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
PTPN13Q12923 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PTPN13Q12923 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PTPN13Q12923 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PTPN13Q12923 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PTPN13Q12923 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PTPN13Q12923 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PTPN13Q12923 MIR1254-1-201ENST00000408257 97 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PTPN13Q12923 RNU6-916P-201ENST00000516088 109 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PTPN13Q12923 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
PTPN13Q12923 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
PTPN13Q12923 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
PTPN13Q12923 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC-1.78□□□□□ -2.69
PTPN13Q12923 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
PTPN13Q12923 RNU6-1047P-201ENST00000364418 107 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
PTPN13Q12923 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
PTPN13Q12923 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
PTPN13Q12923 RNU6-876P-201ENST00000391295 104 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
PTPN13Q12923 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
PTPN13Q12923 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
PTPN13Q12923 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
PTPN13Q12923 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
PTPN13Q12923 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
PTPN13Q12923 RNU6-1340P-201ENST00000384438 107 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
PTPN13Q12923 U6atac.1-201ENST00000616025 117 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
PTPN13Q12923 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
PTPN13Q12923 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PTPN13Q12923 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PTPN13Q12923 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PTPN13Q12923 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PTPN13Q12923 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PTPN13Q12923 SNORA40.16-201ENST00000517238 121 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PTPN13Q12923 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PTPN13Q12923 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
PTPN13Q12923 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PTPN13Q12923 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PTPN13Q12923 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PTPN13Q12923 Y_RNA.137-201ENST00000363455 112 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PTPN13Q12923 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PTPN13Q12923 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PTPN13Q12923 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PTPN13Q12923 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PTPN13Q12923 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PTPN13Q12923 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
PTPN13Q12923 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PTPN13Q12923 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PTPN13Q12923 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PTPN13Q12923 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PTPN13Q12923 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
PTPN13Q12923 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
PTPN13Q12923 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
PTPN13Q12923 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
PTPN13Q12923 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
PTPN13Q12923 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
PTPN13Q12923 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
PTPN13Q12923 RNU6-789P-201ENST00000517105 102 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
PTPN13Q12923 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
PTPN13Q12923 Y_RNA.69-201ENST00000362885 109 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
PTPN13Q12923 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
PTPN13Q12923 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
PTPN13Q12923 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PTPN13Q12923 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
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