Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ERFP50548 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ERFP50548 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ERFP50548 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ERFP50548 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ERFP50548 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ERFP50548 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
ERFP50548 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ERFP50548 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ERFP50548 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ERFP50548 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
ERFP50548 Y_RNA.175-201ENST00000363794 111 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ERFP50548 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ERFP50548 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ERFP50548 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ERFP50548 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ERFP50548 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ERFP50548 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ERFP50548 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
ERFP50548 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ERFP50548 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ERFP50548 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ERFP50548 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ERFP50548 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ERFP50548 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
ERFP50548 LEKR1-212ENST00000640869 237 ntTSL 5 BASIC-1.04□□□□□ -2.58
ERFP50548 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ERFP50548 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ERFP50548 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ERFP50548 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ERFP50548 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ERFP50548 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ERFP50548 MIR496-201ENST00000385226 102 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ERFP50548 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ERFP50548 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ERFP50548 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ERFP50548 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ERFP50548 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
ERFP50548 MIRLET7A2-201ENST00000362105 72 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ERFP50548 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ERFP50548 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
ERFP50548 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ERFP50548 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ERFP50548 RNU6-1247P-201ENST00000516622 98 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ERFP50548 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ERFP50548 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ERFP50548 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ERFP50548 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ERFP50548 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ERFP50548 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
ERFP50548 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
ERFP50548 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
ERFP50548 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
ERFP50548 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
ERFP50548 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
ERFP50548 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
ERFP50548 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
ERFP50548 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
ERFP50548 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
ERFP50548 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
ERFP50548 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
ERFP50548 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
ERFP50548 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
ERFP50548 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ERFP50548 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ERFP50548 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ERFP50548 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ERFP50548 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ERFP50548 Y_RNA.709-201ENST00000516952 92 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ERFP50548 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
ERFP50548 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ERFP50548 Y_RNA.544-201ENST00000384650 113 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ERFP50548 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ERFP50548 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ERFP50548 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ERFP50548 VTRNA2-1-201ENST00000602301 127 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ERFP50548 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ERFP50548 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ERFP50548 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ERFP50548 Y_RNA.316-201ENST00000365118 111 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ERFP50548 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ERFP50548 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
ERFP50548 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ERFP50548 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ERFP50548 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ERFP50548 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ERFP50548 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ERFP50548 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ERFP50548 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ERFP50548 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ERFP50548 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ERFP50548 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ERFP50548 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ERFP50548 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ERFP50548 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ERFP50548 MIR3139-201ENST00000579145 76 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ERFP50548 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ERFP50548 RNU6-1034P-201ENST00000365335 101 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ERFP50548 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ERFP50548 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 204 ms