Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
SFT2D2O95562 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
SFT2D2O95562 Y_RNA.612-201ENST00000410717 95 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
SFT2D2O95562 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
SFT2D2O95562 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC-4.02□□□□□ -3.05
SFT2D2O95562 RNU6-300P-201ENST00000459080 104 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
SFT2D2O95562 RNU6-1206P-201ENST00000516339 103 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
SFT2D2O95562 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
SFT2D2O95562 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
SFT2D2O95562 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
SFT2D2O95562 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-4.02□□□□□ -3.05
SFT2D2O95562 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
SFT2D2O95562 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-4.03□□□□□ -3.05
SFT2D2O95562 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
SFT2D2O95562 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
SFT2D2O95562 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-4.03□□□□□ -3.05
SFT2D2O95562 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
SFT2D2O95562 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
SFT2D2O95562 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
SFT2D2O95562 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
SFT2D2O95562 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC-4.04□□□□□ -3.06
SFT2D2O95562 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
SFT2D2O95562 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
SFT2D2O95562 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
SFT2D2O95562 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC-4.05□□□□□ -3.06
SFT2D2O95562 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
SFT2D2O95562 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
SFT2D2O95562 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-4.06□□□□□ -3.06
SFT2D2O95562 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-4.07□□□□□ -3.06
SFT2D2O95562 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
SFT2D2O95562 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-4.08□□□□□ -3.06
SFT2D2O95562 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
SFT2D2O95562 MIR4484-201ENST00000582855 83 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
SFT2D2O95562 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-4.09□□□□□ -3.06
SFT2D2O95562 SNORD45.2-201ENST00000363552 72 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
SFT2D2O95562 AL359920.1-201ENST00000618332 176 ntBASIC-4.1□□□□□ -3.07
SFT2D2O95562 RNU6-1044P-201ENST00000384755 107 ntBASIC-4.11□□□□□ -3.07
SFT2D2O95562 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC-4.11□□□□□ -3.07
SFT2D2O95562 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
SFT2D2O95562 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
SFT2D2O95562 MIR4795-201ENST00000584182 89 ntBASIC-4.12□□□□□ -3.07
SFT2D2O95562 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
SFT2D2O95562 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
SFT2D2O95562 RNU6-231P-201ENST00000517122 103 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
SFT2D2O95562 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-4.13□□□□□ -3.07
SFT2D2O95562 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
SFT2D2O95562 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
SFT2D2O95562 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
SFT2D2O95562 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC-4.14□□□□□ -3.07
SFT2D2O95562 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
SFT2D2O95562 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
SFT2D2O95562 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC-4.15□□□□□ -3.07
SFT2D2O95562 SNORD114-13-201ENST00000364377 74 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.08
SFT2D2O95562 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.08
SFT2D2O95562 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.08
SFT2D2O95562 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.08
SFT2D2O95562 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-4.16□□□□□ -3.08
SFT2D2O95562 MIR509-1-201ENST00000385265 94 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
SFT2D2O95562 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
SFT2D2O95562 MIR509-2-201ENST00000390724 91 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
SFT2D2O95562 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
SFT2D2O95562 AL451105.1-201ENST00000450005 189 ntBASIC-4.17□□□□□ -3.08
SFT2D2O95562 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
SFT2D2O95562 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
SFT2D2O95562 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
SFT2D2O95562 Y_RNA.652-201ENST00000458902 102 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
SFT2D2O95562 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
SFT2D2O95562 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-4.18□□□□□ -3.08
SFT2D2O95562 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
SFT2D2O95562 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
SFT2D2O95562 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-4.19□□□□□ -3.08
SFT2D2O95562 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
SFT2D2O95562 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
SFT2D2O95562 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
SFT2D2O95562 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
SFT2D2O95562 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC-4.2□□□□□ -3.08
SFT2D2O95562 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC-4.22□□□□□ -3.08
SFT2D2O95562 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-4.22□□□□□ -3.08
SFT2D2O95562 Y_RNA.663-201ENST00000516043 101 ntBASIC-4.22□□□□□ -3.08
SFT2D2O95562 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC-4.22□□□□□ -3.08
SFT2D2O95562 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
SFT2D2O95562 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC-4.23□□□□□ -3.09
SFT2D2O95562 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
SFT2D2O95562 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC-4.23□□□□□ -3.09
SFT2D2O95562 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
SFT2D2O95562 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
SFT2D2O95562 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
SFT2D2O95562 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
SFT2D2O95562 hsa-mir-550a-2.1-201ENST00000637473 97 ntBASIC-4.24□□□□□ -3.09
SFT2D2O95562 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
SFT2D2O95562 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
SFT2D2O95562 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
SFT2D2O95562 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
SFT2D2O95562 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
SFT2D2O95562 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-4.25□□□□□ -3.09
SFT2D2O95562 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
SFT2D2O95562 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
SFT2D2O95562 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
SFT2D2O95562 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-4.26□□□□□ -3.09
SFT2D2O95562 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC-4.27□□□□□ -3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 271 ms