Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
USP18Q9UMW8 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
USP18Q9UMW8 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
USP18Q9UMW8 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
USP18Q9UMW8 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
USP18Q9UMW8 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
USP18Q9UMW8 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
USP18Q9UMW8 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
USP18Q9UMW8 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
USP18Q9UMW8 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
USP18Q9UMW8 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
USP18Q9UMW8 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
USP18Q9UMW8 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
USP18Q9UMW8 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
USP18Q9UMW8 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
USP18Q9UMW8 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
USP18Q9UMW8 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
USP18Q9UMW8 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
USP18Q9UMW8 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
USP18Q9UMW8 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
USP18Q9UMW8 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
USP18Q9UMW8 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
USP18Q9UMW8 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
USP18Q9UMW8 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
USP18Q9UMW8 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
USP18Q9UMW8 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
USP18Q9UMW8 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
USP18Q9UMW8 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
USP18Q9UMW8 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
USP18Q9UMW8 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
USP18Q9UMW8 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
USP18Q9UMW8 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
USP18Q9UMW8 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
USP18Q9UMW8 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
USP18Q9UMW8 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
USP18Q9UMW8 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
USP18Q9UMW8 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
USP18Q9UMW8 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
USP18Q9UMW8 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
USP18Q9UMW8 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
USP18Q9UMW8 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
USP18Q9UMW8 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
USP18Q9UMW8 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
USP18Q9UMW8 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
USP18Q9UMW8 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
USP18Q9UMW8 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
USP18Q9UMW8 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
USP18Q9UMW8 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
USP18Q9UMW8 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
USP18Q9UMW8 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
USP18Q9UMW8 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
USP18Q9UMW8 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
USP18Q9UMW8 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
USP18Q9UMW8 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
USP18Q9UMW8 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
USP18Q9UMW8 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
USP18Q9UMW8 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
USP18Q9UMW8 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
USP18Q9UMW8 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.23□□□□□ -2.45
USP18Q9UMW8 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
USP18Q9UMW8 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
USP18Q9UMW8 TRAJ28-201ENST00000390509 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.24□□□□□ -2.45
USP18Q9UMW8 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
USP18Q9UMW8 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
USP18Q9UMW8 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
USP18Q9UMW8 AC114801.3-201ENST00000510231 177 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
USP18Q9UMW8 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
USP18Q9UMW8 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
USP18Q9UMW8 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
USP18Q9UMW8 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
USP18Q9UMW8 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
USP18Q9UMW8 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
USP18Q9UMW8 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
USP18Q9UMW8 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
USP18Q9UMW8 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
USP18Q9UMW8 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
USP18Q9UMW8 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
USP18Q9UMW8 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
USP18Q9UMW8 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
USP18Q9UMW8 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
USP18Q9UMW8 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
USP18Q9UMW8 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
USP18Q9UMW8 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
USP18Q9UMW8 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
USP18Q9UMW8 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
USP18Q9UMW8 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
USP18Q9UMW8 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
USP18Q9UMW8 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
USP18Q9UMW8 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
USP18Q9UMW8 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
USP18Q9UMW8 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
USP18Q9UMW8 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
USP18Q9UMW8 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
USP18Q9UMW8 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
USP18Q9UMW8 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
USP18Q9UMW8 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
USP18Q9UMW8 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
USP18Q9UMW8 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
USP18Q9UMW8 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
USP18Q9UMW8 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms