Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SYNE4Q8N205 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SYNE4Q8N205 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
SYNE4Q8N205 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.28□□□□□ -2.36
SYNE4Q8N205 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SYNE4Q8N205 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SYNE4Q8N205 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
SYNE4Q8N205 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SYNE4Q8N205 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SYNE4Q8N205 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SYNE4Q8N205 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
SYNE4Q8N205 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SYNE4Q8N205 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SYNE4Q8N205 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SYNE4Q8N205 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
SYNE4Q8N205 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SYNE4Q8N205 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SYNE4Q8N205 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SYNE4Q8N205 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
SYNE4Q8N205 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
SYNE4Q8N205 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SYNE4Q8N205 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SYNE4Q8N205 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SYNE4Q8N205 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
SYNE4Q8N205 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SYNE4Q8N205 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SYNE4Q8N205 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SYNE4Q8N205 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
SYNE4Q8N205 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SYNE4Q8N205 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SYNE4Q8N205 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SYNE4Q8N205 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
SYNE4Q8N205 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SYNE4Q8N205 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SYNE4Q8N205 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SYNE4Q8N205 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
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SYNE4Q8N205 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SYNE4Q8N205 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SYNE4Q8N205 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SYNE4Q8N205 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
SYNE4Q8N205 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SYNE4Q8N205 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SYNE4Q8N205 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
SYNE4Q8N205 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
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SYNE4Q8N205 SNORD116.2-201ENST00000391251 93 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SYNE4Q8N205 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SYNE4Q8N205 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
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SYNE4Q8N205 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SYNE4Q8N205 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SYNE4Q8N205 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SYNE4Q8N205 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SYNE4Q8N205 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SYNE4Q8N205 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SYNE4Q8N205 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SYNE4Q8N205 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SYNE4Q8N205 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SYNE4Q8N205 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
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