Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SGCAQ16586 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-1.37□□□□□ -2.63
SGCAQ16586 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SGCAQ16586 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SGCAQ16586 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SGCAQ16586 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SGCAQ16586 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SGCAQ16586 MIR6818-201ENST00000621576 65 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SGCAQ16586 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC-1.38□□□□□ -2.63
SGCAQ16586 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SGCAQ16586 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SGCAQ16586 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-1.39□□□□□ -2.63
SGCAQ16586 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-1.4□□□□□ -2.63
SGCAQ16586 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-1.4□□□□□ -2.63
SGCAQ16586 RNU6-1325P-201ENST00000364905 105 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SGCAQ16586 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SGCAQ16586 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SGCAQ16586 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SGCAQ16586 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC-1.41□□□□□ -2.64
SGCAQ16586 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SGCAQ16586 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.42□□□□□ -2.64
SGCAQ16586 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SGCAQ16586 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SGCAQ16586 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SGCAQ16586 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SGCAQ16586 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SGCAQ16586 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-1.43□□□□□ -2.64
SGCAQ16586 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SGCAQ16586 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SGCAQ16586 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SGCAQ16586 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SGCAQ16586 HLA-S-202ENST00000425174 53 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SGCAQ16586 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SGCAQ16586 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.44□□□□□ -2.64
SGCAQ16586 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SGCAQ16586 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SGCAQ16586 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SGCAQ16586 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SGCAQ16586 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SGCAQ16586 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SGCAQ16586 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SGCAQ16586 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC-1.45□□□□□ -2.64
SGCAQ16586 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SGCAQ16586 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SGCAQ16586 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SGCAQ16586 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SGCAQ16586 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SGCAQ16586 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
SGCAQ16586 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-1.46□□□□□ -2.64
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SGCAQ16586 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SGCAQ16586 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.53□□□□□ -2.65
SGCAQ16586 MIR5591-201ENST00000578248 65 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SGCAQ16586 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SGCAQ16586 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SGCAQ16586 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SGCAQ16586 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
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SGCAQ16586 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SGCAQ16586 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SGCAQ16586 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
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