Protein–RNA interactions for Protein: Q16512

PKN1, Serine/threonine-protein kinase N1, humanhuman

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Length 942 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKN1Q16512 AC138207.3-201ENST00000585289 166 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
PKN1Q16512 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.9□□□□□ -2.27
PKN1Q16512 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PKN1Q16512 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
PKN1Q16512 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PKN1Q16512 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PKN1Q16512 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PKN1Q16512 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PKN1Q16512 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
PKN1Q16512 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PKN1Q16512 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
PKN1Q16512 RNU6-59P-201ENST00000384787 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PKN1Q16512 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PKN1Q16512 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PKN1Q16512 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
PKN1Q16512 RNA5SP347-201ENST00000362445 119 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PKN1Q16512 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PKN1Q16512 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PKN1Q16512 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PKN1Q16512 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PKN1Q16512 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PKN1Q16512 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
PKN1Q16512 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PKN1Q16512 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PKN1Q16512 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
PKN1Q16512 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
PKN1Q16512 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PKN1Q16512 RNU6-822P-201ENST00000362707 106 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PKN1Q16512 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PKN1Q16512 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PKN1Q16512 U6.103-201ENST00000637085 61 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
PKN1Q16512 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PKN1Q16512 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PKN1Q16512 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PKN1Q16512 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PKN1Q16512 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
PKN1Q16512 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.83□□□□□ -2.28
PKN1Q16512 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PKN1Q16512 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PKN1Q16512 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
PKN1Q16512 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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PKN1Q16512 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC0.8□□□□□ -2.28
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PKN1Q16512 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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PKN1Q16512 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.79□□□□□ -2.28
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PKN1Q16512 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC0.78□□□□□ -2.28
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PKN1Q16512 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PKN1Q16512 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PKN1Q16512 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PKN1Q16512 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
PKN1Q16512 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
PKN1Q16512 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PKN1Q16512 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PKN1Q16512 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
PKN1Q16512 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
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PKN1Q16512 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
PKN1Q16512 RNU6-732P-201ENST00000516033 103 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PKN1Q16512 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PKN1Q16512 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
PKN1Q16512 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PKN1Q16512 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
PKN1Q16512 Y_RNA.345-201ENST00000365384 92 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
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PKN1Q16512 RNU6-1326P-201ENST00000391262 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
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PKN1Q16512 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PKN1Q16512 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PKN1Q16512 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PKN1Q16512 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PKN1Q16512 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PKN1Q16512 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PKN1Q16512 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PKN1Q16512 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PKN1Q16512 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PKN1Q16512 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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