Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LAPTM4AQ15012 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
LAPTM4AQ15012 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LAPTM4AQ15012 MIR548N-201ENST00000408742 75 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LAPTM4AQ15012 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LAPTM4AQ15012 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LAPTM4AQ15012 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LAPTM4AQ15012 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
LAPTM4AQ15012 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LAPTM4AQ15012 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.406-201ENST00000383984 100 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LAPTM4AQ15012 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LAPTM4AQ15012 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
LAPTM4AQ15012 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LAPTM4AQ15012 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LAPTM4AQ15012 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
LAPTM4AQ15012 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
LAPTM4AQ15012 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LAPTM4AQ15012 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LAPTM4AQ15012 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
LAPTM4AQ15012 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LAPTM4AQ15012 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LAPTM4AQ15012 SMAD5-AS1_3.1-201ENST00000614187 124 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
LAPTM4AQ15012 SNORD114-24-201ENST00000365029 72 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
LAPTM4AQ15012 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.260-201ENST00000364628 101 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LAPTM4AQ15012 MIR6854-201ENST00000614935 69 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LAPTM4AQ15012 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
LAPTM4AQ15012 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
LAPTM4AQ15012 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LAPTM4AQ15012 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
LAPTM4AQ15012 RNU6-1169P-201ENST00000363537 103 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LAPTM4AQ15012 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LAPTM4AQ15012 RNA5SP224-201ENST00000365069 126 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LAPTM4AQ15012 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LAPTM4AQ15012 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LAPTM4AQ15012 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LAPTM4AQ15012 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LAPTM4AQ15012 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LAPTM4AQ15012 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
LAPTM4AQ15012 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
LAPTM4AQ15012 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LAPTM4AQ15012 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
LAPTM4AQ15012 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LAPTM4AQ15012 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LAPTM4AQ15012 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LAPTM4AQ15012 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LAPTM4AQ15012 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LAPTM4AQ15012 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LAPTM4AQ15012 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
LAPTM4AQ15012 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LAPTM4AQ15012 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LAPTM4AQ15012 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LAPTM4AQ15012 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
LAPTM4AQ15012 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
LAPTM4AQ15012 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LAPTM4AQ15012 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LAPTM4AQ15012 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
LAPTM4AQ15012 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LAPTM4AQ15012 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LAPTM4AQ15012 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
LAPTM4AQ15012 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LAPTM4AQ15012 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LAPTM4AQ15012 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LAPTM4AQ15012 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LAPTM4AQ15012 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LAPTM4AQ15012 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
LAPTM4AQ15012 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
LAPTM4AQ15012 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
LAPTM4AQ15012 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LAPTM4AQ15012 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
LAPTM4AQ15012 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
LAPTM4AQ15012 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LAPTM4AQ15012 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
LAPTM4AQ15012 RNU6ATAC20P-201ENST00000408436 127 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LAPTM4AQ15012 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
LAPTM4AQ15012 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LAPTM4AQ15012 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LAPTM4AQ15012 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LAPTM4AQ15012 MIAT_exon5_2.1-201ENST00000613562 85 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LAPTM4AQ15012 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
LAPTM4AQ15012 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.335-201ENST00000365299 96 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LAPTM4AQ15012 MIR598-201ENST00000384868 97 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LAPTM4AQ15012 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LAPTM4AQ15012 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
LAPTM4AQ15012 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LAPTM4AQ15012 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LAPTM4AQ15012 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LAPTM4AQ15012 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LAPTM4AQ15012 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
LAPTM4AQ15012 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
LAPTM4AQ15012 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LAPTM4AQ15012 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LAPTM4AQ15012 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
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