Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

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Length 1,093 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
LRIG1Q96JA1 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
LRIG1Q96JA1 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
LRIG1Q96JA1 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
LRIG1Q96JA1 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
LRIG1Q96JA1 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
LRIG1Q96JA1 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
LRIG1Q96JA1 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC0.15□□□□□ -2.39
LRIG1Q96JA1 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
LRIG1Q96JA1 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
LRIG1Q96JA1 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
LRIG1Q96JA1 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
LRIG1Q96JA1 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
LRIG1Q96JA1 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
LRIG1Q96JA1 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
LRIG1Q96JA1 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.14□□□□□ -2.39
LRIG1Q96JA1 MIR604-201ENST00000384880 94 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
LRIG1Q96JA1 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
LRIG1Q96JA1 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
LRIG1Q96JA1 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
LRIG1Q96JA1 RNU6-70P-201ENST00000516438 60 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
LRIG1Q96JA1 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
LRIG1Q96JA1 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
LRIG1Q96JA1 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
LRIG1Q96JA1 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
LRIG1Q96JA1 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
LRIG1Q96JA1 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
LRIG1Q96JA1 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
LRIG1Q96JA1 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
LRIG1Q96JA1 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
LRIG1Q96JA1 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
LRIG1Q96JA1 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
LRIG1Q96JA1 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
LRIG1Q96JA1 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
LRIG1Q96JA1 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
LRIG1Q96JA1 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
LRIG1Q96JA1 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
LRIG1Q96JA1 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
LRIG1Q96JA1 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
LRIG1Q96JA1 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
LRIG1Q96JA1 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
LRIG1Q96JA1 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
LRIG1Q96JA1 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
LRIG1Q96JA1 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LRIG1Q96JA1 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LRIG1Q96JA1 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
LRIG1Q96JA1 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LRIG1Q96JA1 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LRIG1Q96JA1 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LRIG1Q96JA1 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LRIG1Q96JA1 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
LRIG1Q96JA1 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LRIG1Q96JA1 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LRIG1Q96JA1 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LRIG1Q96JA1 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LRIG1Q96JA1 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
LRIG1Q96JA1 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LRIG1Q96JA1 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LRIG1Q96JA1 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LRIG1Q96JA1 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LRIG1Q96JA1 Y_RNA.788-201ENST00000622394 112 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LRIG1Q96JA1 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
LRIG1Q96JA1 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
LRIG1Q96JA1 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
LRIG1Q96JA1 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
LRIG1Q96JA1 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
LRIG1Q96JA1 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
LRIG1Q96JA1 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
LRIG1Q96JA1 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
LRIG1Q96JA1 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LRIG1Q96JA1 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LRIG1Q96JA1 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LRIG1Q96JA1 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LRIG1Q96JA1 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
LRIG1Q96JA1 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LRIG1Q96JA1 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LRIG1Q96JA1 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LRIG1Q96JA1 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC0□□□□□ -2.41
LRIG1Q96JA1 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
LRIG1Q96JA1 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
LRIG1Q96JA1 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
LRIG1Q96JA1 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
LRIG1Q96JA1 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
LRIG1Q96JA1 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
LRIG1Q96JA1 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
LRIG1Q96JA1 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LRIG1Q96JA1 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
LRIG1Q96JA1 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LRIG1Q96JA1 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LRIG1Q96JA1 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LRIG1Q96JA1 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
LRIG1Q96JA1 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LRIG1Q96JA1 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LRIG1Q96JA1 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LRIG1Q96JA1 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
LRIG1Q96JA1 SNORA18.1-201ENST00000363418 128 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
LRIG1Q96JA1 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
LRIG1Q96JA1 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
LRIG1Q96JA1 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
LRIG1Q96JA1 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
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