Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
KNOP1Q1ED39 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
KNOP1Q1ED39 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
KNOP1Q1ED39 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
KNOP1Q1ED39 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
KNOP1Q1ED39 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
KNOP1Q1ED39 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
KNOP1Q1ED39 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
KNOP1Q1ED39 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
KNOP1Q1ED39 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
KNOP1Q1ED39 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
KNOP1Q1ED39 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
KNOP1Q1ED39 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
KNOP1Q1ED39 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
KNOP1Q1ED39 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
KNOP1Q1ED39 SNORA32.3-201ENST00000384772 121 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
KNOP1Q1ED39 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-0.68□□□□□ -2.52
KNOP1Q1ED39 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
KNOP1Q1ED39 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
KNOP1Q1ED39 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
KNOP1Q1ED39 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
KNOP1Q1ED39 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
KNOP1Q1ED39 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
KNOP1Q1ED39 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
KNOP1Q1ED39 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
KNOP1Q1ED39 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
KNOP1Q1ED39 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
KNOP1Q1ED39 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
KNOP1Q1ED39 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
KNOP1Q1ED39 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
KNOP1Q1ED39 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
KNOP1Q1ED39 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
KNOP1Q1ED39 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
KNOP1Q1ED39 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
KNOP1Q1ED39 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
KNOP1Q1ED39 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
KNOP1Q1ED39 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
KNOP1Q1ED39 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
KNOP1Q1ED39 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
KNOP1Q1ED39 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
KNOP1Q1ED39 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
KNOP1Q1ED39 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
KNOP1Q1ED39 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
KNOP1Q1ED39 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
KNOP1Q1ED39 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
KNOP1Q1ED39 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
KNOP1Q1ED39 SNORD75.1-201ENST00000408373 60 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
KNOP1Q1ED39 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
KNOP1Q1ED39 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
KNOP1Q1ED39 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
KNOP1Q1ED39 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
KNOP1Q1ED39 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
KNOP1Q1ED39 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
KNOP1Q1ED39 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
KNOP1Q1ED39 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
KNOP1Q1ED39 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
KNOP1Q1ED39 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
KNOP1Q1ED39 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
KNOP1Q1ED39 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
KNOP1Q1ED39 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.610-201ENST00000410681 103 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
KNOP1Q1ED39 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
KNOP1Q1ED39 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
KNOP1Q1ED39 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
KNOP1Q1ED39 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
KNOP1Q1ED39 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
KNOP1Q1ED39 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
KNOP1Q1ED39 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
KNOP1Q1ED39 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
KNOP1Q1ED39 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
KNOP1Q1ED39 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
KNOP1Q1ED39 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
KNOP1Q1ED39 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
KNOP1Q1ED39 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
KNOP1Q1ED39 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
KNOP1Q1ED39 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
KNOP1Q1ED39 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
KNOP1Q1ED39 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
KNOP1Q1ED39 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
KNOP1Q1ED39 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
KNOP1Q1ED39 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
KNOP1Q1ED39 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
KNOP1Q1ED39 hsa-mir-4536-1.1-201ENST00000636519 88 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
KNOP1Q1ED39 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
KNOP1Q1ED39 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
KNOP1Q1ED39 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
KNOP1Q1ED39 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
KNOP1Q1ED39 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
KNOP1Q1ED39 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 223.6 ms