Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AC022559.1-201ENST00000520905 205 ntBASIC-2.65□□□□□ -2.83
NEDD8Q15843 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
NEDD8Q15843 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
NEDD8Q15843 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
NEDD8Q15843 MIR548W-201ENST00000581970 74 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
NEDD8Q15843 MIR3170-201ENST00000582699 77 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
NEDD8Q15843 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-2.66□□□□□ -2.84
NEDD8Q15843 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
NEDD8Q15843 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-2.67□□□□□ -2.84
NEDD8Q15843 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
NEDD8Q15843 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
NEDD8Q15843 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
NEDD8Q15843 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-2.68□□□□□ -2.84
NEDD8Q15843 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
NEDD8Q15843 RNU6-1111P-201ENST00000391118 107 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
NEDD8Q15843 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
NEDD8Q15843 U7.2-201ENST00000607576 63 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
NEDD8Q15843 U2.18-201ENST00000622185 84 ntBASIC-2.69□□□□□ -2.84
NEDD8Q15843 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
NEDD8Q15843 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
NEDD8Q15843 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-2.7□□□□□ -2.84
NEDD8Q15843 RNU6-1267P-201ENST00000410747 107 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
NEDD8Q15843 Y_RNA.684-201ENST00000516510 99 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
NEDD8Q15843 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
NEDD8Q15843 SNORD19B.1-201ENST00000630615 80 ntBASIC-2.71□□□□□ -2.84
NEDD8Q15843 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
NEDD8Q15843 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
NEDD8Q15843 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
NEDD8Q15843 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
NEDD8Q15843 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
NEDD8Q15843 snoU13.10-201ENST00000459301 103 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
NEDD8Q15843 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
NEDD8Q15843 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-2.72□□□□□ -2.84
NEDD8Q15843 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
NEDD8Q15843 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
NEDD8Q15843 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-2.73□□□□□ -2.85
NEDD8Q15843 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
NEDD8Q15843 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
NEDD8Q15843 Y_RNA.420-201ENST00000384043 110 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
NEDD8Q15843 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
NEDD8Q15843 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
NEDD8Q15843 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
NEDD8Q15843 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
NEDD8Q15843 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
NEDD8Q15843 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
NEDD8Q15843 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-2.74□□□□□ -2.85
NEDD8Q15843 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
NEDD8Q15843 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
NEDD8Q15843 RNU6-1306P-201ENST00000365219 99 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
NEDD8Q15843 MIR548AA1-201ENST00000384971 97 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
NEDD8Q15843 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
NEDD8Q15843 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
NEDD8Q15843 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
NEDD8Q15843 AC013734.1-201ENST00000619329 111 ntBASIC-2.75□□□□□ -2.85
NEDD8Q15843 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
NEDD8Q15843 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
NEDD8Q15843 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
NEDD8Q15843 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
NEDD8Q15843 Y_RNA.699-201ENST00000516803 93 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
NEDD8Q15843 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
NEDD8Q15843 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-2.76□□□□□ -2.85
NEDD8Q15843 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
NEDD8Q15843 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
NEDD8Q15843 TRAJ33-201ENST00000390504 57 ntAPPRIS P1 BASIC-2.77□□□□□ -2.85
NEDD8Q15843 hsa-mir-4773-1.1-201ENST00000585225 78 ntBASIC-2.77□□□□□ -2.85
NEDD8Q15843 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
NEDD8Q15843 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC-2.78□□□□□ -2.85
NEDD8Q15843 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
NEDD8Q15843 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
NEDD8Q15843 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC-2.79□□□□□ -2.86
NEDD8Q15843 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
NEDD8Q15843 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
NEDD8Q15843 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
NEDD8Q15843 FTX_4.1-201ENST00000616291 147 ntBASIC-2.8□□□□□ -2.86
NEDD8Q15843 RNU6-247P-201ENST00000362636 107 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
NEDD8Q15843 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
NEDD8Q15843 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
NEDD8Q15843 MTRNR2L9-201ENST00000622562 75 ntBASIC-2.81□□□□□ -2.86
NEDD8Q15843 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
NEDD8Q15843 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
NEDD8Q15843 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
NEDD8Q15843 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC-2.82□□□□□ -2.86
NEDD8Q15843 SNORA27.2-201ENST00000363365 126 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
NEDD8Q15843 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-2.83□□□□□ -2.86
NEDD8Q15843 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
NEDD8Q15843 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
NEDD8Q15843 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
NEDD8Q15843 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
NEDD8Q15843 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC-2.84□□□□□ -2.86
NEDD8Q15843 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
NEDD8Q15843 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
NEDD8Q15843 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
NEDD8Q15843 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
NEDD8Q15843 SPRY4-IT1_2.1-201ENST00000612613 121 ntBASIC-2.85□□□□□ -2.87
NEDD8Q15843 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
NEDD8Q15843 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
NEDD8Q15843 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
NEDD8Q15843 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
NEDD8Q15843 U6.97-201ENST00000636904 101 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
NEDD8Q15843 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 217.5 ms