Protein–RNA interactions for Protein: Q15672

TWIST1, Twist-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWIST1Q15672 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TWIST1Q15672 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TWIST1Q15672 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TWIST1Q15672 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TWIST1Q15672 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TWIST1Q15672 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TWIST1Q15672 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
TWIST1Q15672 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TWIST1Q15672 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TWIST1Q15672 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TWIST1Q15672 MIR548H2-201ENST00000408874 88 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TWIST1Q15672 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TWIST1Q15672 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TWIST1Q15672 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TWIST1Q15672 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TWIST1Q15672 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TWIST1Q15672 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TWIST1Q15672 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
TWIST1Q15672 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TWIST1Q15672 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TWIST1Q15672 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TWIST1Q15672 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
TWIST1Q15672 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TWIST1Q15672 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TWIST1Q15672 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TWIST1Q15672 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TWIST1Q15672 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TWIST1Q15672 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
TWIST1Q15672 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TWIST1Q15672 CPEB3_ribozyme.1-201ENST00000408115 78 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TWIST1Q15672 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TWIST1Q15672 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
TWIST1Q15672 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TWIST1Q15672 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TWIST1Q15672 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TWIST1Q15672 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
TWIST1Q15672 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TWIST1Q15672 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TWIST1Q15672 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TWIST1Q15672 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TWIST1Q15672 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TWIST1Q15672 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TWIST1Q15672 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TWIST1Q15672 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TWIST1Q15672 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TWIST1Q15672 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TWIST1Q15672 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TWIST1Q15672 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TWIST1Q15672 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TWIST1Q15672 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
TWIST1Q15672 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TWIST1Q15672 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TWIST1Q15672 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TWIST1Q15672 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TWIST1Q15672 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TWIST1Q15672 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
TWIST1Q15672 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TWIST1Q15672 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TWIST1Q15672 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TWIST1Q15672 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TWIST1Q15672 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TWIST1Q15672 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
TWIST1Q15672 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TWIST1Q15672 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TWIST1Q15672 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
TWIST1Q15672 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TWIST1Q15672 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
TWIST1Q15672 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TWIST1Q15672 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TWIST1Q15672 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TWIST1Q15672 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TWIST1Q15672 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TWIST1Q15672 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TWIST1Q15672 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
TWIST1Q15672 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TWIST1Q15672 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TWIST1Q15672 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TWIST1Q15672 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TWIST1Q15672 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
TWIST1Q15672 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TWIST1Q15672 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TWIST1Q15672 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
TWIST1Q15672 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TWIST1Q15672 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TWIST1Q15672 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
TWIST1Q15672 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TWIST1Q15672 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TWIST1Q15672 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TWIST1Q15672 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TWIST1Q15672 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TWIST1Q15672 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
TWIST1Q15672 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TWIST1Q15672 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TWIST1Q15672 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TWIST1Q15672 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TWIST1Q15672 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TWIST1Q15672 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TWIST1Q15672 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
TWIST1Q15672 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
TWIST1Q15672 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 220.5 ms