Protein–RNA interactions for Protein: Q15198

PDGFRL, Platelet-derived growth factor receptor-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRLQ15198 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
PDGFRLQ15198 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PDGFRLQ15198 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PDGFRLQ15198 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PDGFRLQ15198 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PDGFRLQ15198 Y_RNA.603-201ENST00000410571 108 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PDGFRLQ15198 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PDGFRLQ15198 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PDGFRLQ15198 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PDGFRLQ15198 RNU6-1174P-201ENST00000517278 101 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PDGFRLQ15198 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
PDGFRLQ15198 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PDGFRLQ15198 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
PDGFRLQ15198 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PDGFRLQ15198 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PDGFRLQ15198 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PDGFRLQ15198 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PDGFRLQ15198 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
PDGFRLQ15198 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PDGFRLQ15198 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PDGFRLQ15198 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PDGFRLQ15198 AC104211.3-201ENST00000518861 270 ntTSL 3 BASIC-1.89□□□□□ -2.71
PDGFRLQ15198 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
PDGFRLQ15198 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PDGFRLQ15198 RNU6-608P-201ENST00000383927 104 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PDGFRLQ15198 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
PDGFRLQ15198 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
PDGFRLQ15198 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
PDGFRLQ15198 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
PDGFRLQ15198 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
PDGFRLQ15198 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
PDGFRLQ15198 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
PDGFRLQ15198 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
PDGFRLQ15198 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PDGFRLQ15198 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PDGFRLQ15198 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PDGFRLQ15198 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PDGFRLQ15198 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PDGFRLQ15198 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PDGFRLQ15198 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
PDGFRLQ15198 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PDGFRLQ15198 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PDGFRLQ15198 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PDGFRLQ15198 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
PDGFRLQ15198 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PDGFRLQ15198 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PDGFRLQ15198 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PDGFRLQ15198 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PDGFRLQ15198 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PDGFRLQ15198 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PDGFRLQ15198 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-1.95□□□□□ -2.72
PDGFRLQ15198 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
PDGFRLQ15198 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PDGFRLQ15198 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
PDGFRLQ15198 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PDGFRLQ15198 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PDGFRLQ15198 RNU6-196P-201ENST00000384315 107 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PDGFRLQ15198 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PDGFRLQ15198 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-1.97□□□□□ -2.72
PDGFRLQ15198 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
PDGFRLQ15198 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-1.97□□□□□ -2.72
PDGFRLQ15198 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PDGFRLQ15198 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PDGFRLQ15198 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PDGFRLQ15198 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PDGFRLQ15198 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PDGFRLQ15198 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
PDGFRLQ15198 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PDGFRLQ15198 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PDGFRLQ15198 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PDGFRLQ15198 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PDGFRLQ15198 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PDGFRLQ15198 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PDGFRLQ15198 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
PDGFRLQ15198 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PDGFRLQ15198 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
PDGFRLQ15198 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
PDGFRLQ15198 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
PDGFRLQ15198 RNU7-107P-201ENST00000459121 61 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
PDGFRLQ15198 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
PDGFRLQ15198 Y_RNA.211-201ENST00000364164 101 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
PDGFRLQ15198 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
PDGFRLQ15198 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
PDGFRLQ15198 RNA5SP405-201ENST00000363059 114 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
PDGFRLQ15198 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
PDGFRLQ15198 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
PDGFRLQ15198 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
PDGFRLQ15198 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
PDGFRLQ15198 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
PDGFRLQ15198 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
PDGFRLQ15198 Y_RNA.564-201ENST00000384708 106 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
PDGFRLQ15198 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
PDGFRLQ15198 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-2.04□□□□□ -2.74
PDGFRLQ15198 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
PDGFRLQ15198 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
PDGFRLQ15198 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
PDGFRLQ15198 Y_RNA.55-201ENST00000362797 102 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
PDGFRLQ15198 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
PDGFRLQ15198 RNU6-258P-201ENST00000390884 101 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
PDGFRLQ15198 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
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