Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SNX17Q15036 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
SNX17Q15036 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.73□□□□□ -2.29
SNX17Q15036 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SNX17Q15036 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SNX17Q15036 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SNX17Q15036 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SNX17Q15036 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SNX17Q15036 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
SNX17Q15036 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SNX17Q15036 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SNX17Q15036 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SNX17Q15036 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SNX17Q15036 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SNX17Q15036 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SNX17Q15036 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SNX17Q15036 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
SNX17Q15036 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.7□□□□□ -2.3
SNX17Q15036 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SNX17Q15036 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SNX17Q15036 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SNX17Q15036 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC0.7□□□□□ -2.3
SNX17Q15036 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SNX17Q15036 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SNX17Q15036 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SNX17Q15036 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SNX17Q15036 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
SNX17Q15036 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SNX17Q15036 RNU6-1036P-201ENST00000383959 104 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SNX17Q15036 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SNX17Q15036 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SNX17Q15036 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SNX17Q15036 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
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SNX17Q15036 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SNX17Q15036 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SNX17Q15036 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SNX17Q15036 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SNX17Q15036 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SNX17Q15036 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SNX17Q15036 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SNX17Q15036 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SNX17Q15036 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SNX17Q15036 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SNX17Q15036 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SNX17Q15036 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SNX17Q15036 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SNX17Q15036 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SNX17Q15036 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SNX17Q15036 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
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SNX17Q15036 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
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SNX17Q15036 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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SNX17Q15036 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
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SNX17Q15036 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
SNX17Q15036 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNX17Q15036 MIR527-201ENST00000385244 85 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNX17Q15036 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.58□□□□□ -2.32
SNX17Q15036 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
SNX17Q15036 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.58□□□□□ -2.32
SNX17Q15036 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNX17Q15036 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNX17Q15036 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
SNX17Q15036 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
SNX17Q15036 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
SNX17Q15036 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SNX17Q15036 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SNX17Q15036 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
SNX17Q15036 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNX17Q15036 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNX17Q15036 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
SNX17Q15036 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNX17Q15036 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNX17Q15036 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
SNX17Q15036 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
SNX17Q15036 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNX17Q15036 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNX17Q15036 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
SNX17Q15036 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNX17Q15036 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNX17Q15036 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
SNX17Q15036 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
SNX17Q15036 SNORD116-16-201ENST00000384533 92 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNX17Q15036 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNX17Q15036 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
SNX17Q15036 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
SNX17Q15036 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
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