Protein–RNA interactions for Protein: Q13889

GTF2H3, General transcription factor IIH subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H3Q13889 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
GTF2H3Q13889 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
GTF2H3Q13889 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
GTF2H3Q13889 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
GTF2H3Q13889 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
GTF2H3Q13889 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
GTF2H3Q13889 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
GTF2H3Q13889 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
GTF2H3Q13889 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
GTF2H3Q13889 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
GTF2H3Q13889 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
GTF2H3Q13889 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GTF2H3Q13889 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GTF2H3Q13889 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
GTF2H3Q13889 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.1□□□□□ -2.39
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GTF2H3Q13889 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GTF2H3Q13889 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GTF2H3Q13889 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GTF2H3Q13889 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GTF2H3Q13889 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
GTF2H3Q13889 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
GTF2H3Q13889 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
GTF2H3Q13889 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
GTF2H3Q13889 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
GTF2H3Q13889 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
GTF2H3Q13889 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
GTF2H3Q13889 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
GTF2H3Q13889 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GTF2H3Q13889 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GTF2H3Q13889 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GTF2H3Q13889 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GTF2H3Q13889 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GTF2H3Q13889 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GTF2H3Q13889 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
GTF2H3Q13889 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
GTF2H3Q13889 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
GTF2H3Q13889 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
GTF2H3Q13889 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
GTF2H3Q13889 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
GTF2H3Q13889 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
GTF2H3Q13889 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
GTF2H3Q13889 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
GTF2H3Q13889 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
GTF2H3Q13889 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.01□□□□□ -2.41
GTF2H3Q13889 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
GTF2H3Q13889 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
GTF2H3Q13889 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
GTF2H3Q13889 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
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GTF2H3Q13889 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
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GTF2H3Q13889 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0□□□□□ -2.41
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GTF2H3Q13889 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
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GTF2H3Q13889 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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GTF2H3Q13889 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
GTF2H3Q13889 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
GTF2H3Q13889 MIR8068-201ENST00000618032 68 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
GTF2H3Q13889 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
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GTF2H3Q13889 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
GTF2H3Q13889 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
GTF2H3Q13889 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
GTF2H3Q13889 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
GTF2H3Q13889 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
GTF2H3Q13889 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
GTF2H3Q13889 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
GTF2H3Q13889 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
GTF2H3Q13889 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
GTF2H3Q13889 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
GTF2H3Q13889 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
GTF2H3Q13889 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
GTF2H3Q13889 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
GTF2H3Q13889 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
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