Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
PTP4A2Q12974 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.65□□□□□ -2.51
PTP4A2Q12974 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
PTP4A2Q12974 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
PTP4A2Q12974 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC-0.65□□□□□ -2.51
PTP4A2Q12974 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PTP4A2Q12974 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PTP4A2Q12974 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PTP4A2Q12974 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PTP4A2Q12974 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-0.66□□□□□ -2.52
PTP4A2Q12974 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PTP4A2Q12974 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PTP4A2Q12974 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.66□□□□□ -2.52
PTP4A2Q12974 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTP4A2Q12974 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-0.67□□□□□ -2.52
PTP4A2Q12974 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTP4A2Q12974 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTP4A2Q12974 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTP4A2Q12974 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTP4A2Q12974 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTP4A2Q12974 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTP4A2Q12974 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTP4A2Q12974 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-0.68□□□□□ -2.52
PTP4A2Q12974 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTP4A2Q12974 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTP4A2Q12974 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTP4A2Q12974 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTP4A2Q12974 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTP4A2Q12974 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.69□□□□□ -2.52
PTP4A2Q12974 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTP4A2Q12974 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTP4A2Q12974 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTP4A2Q12974 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTP4A2Q12974 SNORD116-22-201ENST00000384430 92 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTP4A2Q12974 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTP4A2Q12974 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTP4A2Q12974 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTP4A2Q12974 MIR4668-201ENST00000582284 70 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTP4A2Q12974 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
PTP4A2Q12974 SNORA63.4-201ENST00000362763 126 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTP4A2Q12974 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTP4A2Q12974 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTP4A2Q12974 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTP4A2Q12974 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
PTP4A2Q12974 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTP4A2Q12974 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTP4A2Q12974 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTP4A2Q12974 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTP4A2Q12974 RNU6-1236P-201ENST00000517080 99 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTP4A2Q12974 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
PTP4A2Q12974 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTP4A2Q12974 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTP4A2Q12974 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTP4A2Q12974 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTP4A2Q12974 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTP4A2Q12974 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTP4A2Q12974 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
PTP4A2Q12974 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTP4A2Q12974 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTP4A2Q12974 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTP4A2Q12974 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTP4A2Q12974 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTP4A2Q12974 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTP4A2Q12974 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
PTP4A2Q12974 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTP4A2Q12974 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTP4A2Q12974 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTP4A2Q12974 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTP4A2Q12974 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTP4A2Q12974 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTP4A2Q12974 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTP4A2Q12974 HOTAIRM1_3.1-201ENST00000619974 59 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
PTP4A2Q12974 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTP4A2Q12974 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTP4A2Q12974 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTP4A2Q12974 RNU6-147P-201ENST00000383983 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTP4A2Q12974 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTP4A2Q12974 MIR3681-201ENST00000580089 72 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
PTP4A2Q12974 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTP4A2Q12974 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTP4A2Q12974 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTP4A2Q12974 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
PTP4A2Q12974 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTP4A2Q12974 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTP4A2Q12974 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTP4A2Q12974 MIR4499-201ENST00000584834 69 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
PTP4A2Q12974 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTP4A2Q12974 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTP4A2Q12974 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTP4A2Q12974 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTP4A2Q12974 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTP4A2Q12974 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTP4A2Q12974 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTP4A2Q12974 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTP4A2Q12974 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
PTP4A2Q12974 Y_RNA.244-201ENST00000364484 109 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTP4A2Q12974 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTP4A2Q12974 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
PTP4A2Q12974 MIR409-201ENST00000362237 79 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
PTP4A2Q12974 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.1 ms