Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
HMGXB3Q12766 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
HMGXB3Q12766 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
HMGXB3Q12766 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC-3.08□□□□□ -2.9
HMGXB3Q12766 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
HMGXB3Q12766 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
HMGXB3Q12766 Y_RNA.830-201ENST00000628531 96 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
HMGXB3Q12766 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
HMGXB3Q12766 SNORD1B-201ENST00000363091 84 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
HMGXB3Q12766 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
HMGXB3Q12766 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
HMGXB3Q12766 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
HMGXB3Q12766 Y_RNA.511-201ENST00000384514 103 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
HMGXB3Q12766 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
HMGXB3Q12766 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
HMGXB3Q12766 MIR5693-201ENST00000577722 73 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
HMGXB3Q12766 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC-3.09□□□□□ -2.9
HMGXB3Q12766 MIR125B1-201ENST00000385236 88 ntBASIC-3.1□□□□□ -2.91
HMGXB3Q12766 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
HMGXB3Q12766 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
HMGXB3Q12766 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
HMGXB3Q12766 RNY4P25-201ENST00000459254 96 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
HMGXB3Q12766 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-3.11□□□□□ -2.91
HMGXB3Q12766 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
HMGXB3Q12766 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
HMGXB3Q12766 RNU6-974P-201ENST00000384099 108 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
HMGXB3Q12766 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
HMGXB3Q12766 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
HMGXB3Q12766 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
HMGXB3Q12766 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-3.12□□□□□ -2.91
HMGXB3Q12766 RNU6-361P-201ENST00000364454 107 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
HMGXB3Q12766 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
HMGXB3Q12766 SNORA17.4-201ENST00000391287 132 ntBASIC-3.13□□□□□ -2.91
HMGXB3Q12766 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
HMGXB3Q12766 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
HMGXB3Q12766 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
HMGXB3Q12766 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
HMGXB3Q12766 AL731768.1-201ENST00000603124 139 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
HMGXB3Q12766 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
HMGXB3Q12766 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-3.14□□□□□ -2.91
HMGXB3Q12766 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
HMGXB3Q12766 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
HMGXB3Q12766 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-3.15□□□□□ -2.91
HMGXB3Q12766 MIR202-201ENST00000362219 110 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
HMGXB3Q12766 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
HMGXB3Q12766 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
HMGXB3Q12766 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
HMGXB3Q12766 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC-3.16□□□□□ -2.92
HMGXB3Q12766 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
HMGXB3Q12766 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
HMGXB3Q12766 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
HMGXB3Q12766 MIR579-201ENST00000385221 98 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
HMGXB3Q12766 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
HMGXB3Q12766 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-3.17□□□□□ -2.92
HMGXB3Q12766 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
HMGXB3Q12766 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
HMGXB3Q12766 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
HMGXB3Q12766 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-3.18□□□□□ -2.92
HMGXB3Q12766 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
HMGXB3Q12766 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
HMGXB3Q12766 AL513128.1-201ENST00000422675 469 ntTSL 5 BASIC-3.19□□□□□ -2.92
HMGXB3Q12766 Y_RNA.139-201ENST00000363464 102 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
HMGXB3Q12766 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
HMGXB3Q12766 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
HMGXB3Q12766 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
HMGXB3Q12766 MIR513C-201ENST00000401352 84 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
HMGXB3Q12766 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC-3.19□□□□□ -2.92
HMGXB3Q12766 MIRLET7A3-201ENST00000362116 74 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
HMGXB3Q12766 RNU6-530P-201ENST00000391180 107 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
HMGXB3Q12766 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
HMGXB3Q12766 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
HMGXB3Q12766 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
HMGXB3Q12766 RNU6-68P-201ENST00000516576 104 ntBASIC-3.2□□□□□ -2.92
HMGXB3Q12766 MIR548AJ2-201ENST00000408539 92 ntBASIC-3.21□□□□□ -2.92
HMGXB3Q12766 Y_RNA.129-201ENST00000363392 110 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
HMGXB3Q12766 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
HMGXB3Q12766 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
HMGXB3Q12766 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-3.22□□□□□ -2.92
HMGXB3Q12766 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
HMGXB3Q12766 RNU6-172P-201ENST00000411000 93 ntBASIC-3.23□□□□□ -2.93
HMGXB3Q12766 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
HMGXB3Q12766 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
HMGXB3Q12766 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
HMGXB3Q12766 RNU7-160P-201ENST00000516660 62 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
HMGXB3Q12766 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
HMGXB3Q12766 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
HMGXB3Q12766 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
HMGXB3Q12766 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC-3.24□□□□□ -2.93
HMGXB3Q12766 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
HMGXB3Q12766 Y_RNA.266-201ENST00000364678 96 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
HMGXB3Q12766 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
HMGXB3Q12766 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-3.25□□□□□ -2.93
HMGXB3Q12766 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
HMGXB3Q12766 Y_RNA.612-201ENST00000410717 95 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
HMGXB3Q12766 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC-3.26□□□□□ -2.93
HMGXB3Q12766 RNU6-795P-201ENST00000516323 103 ntBASIC-3.26□□□□□ -2.93
HMGXB3Q12766 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
HMGXB3Q12766 Y_RNA.134-201ENST00000363435 105 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
HMGXB3Q12766 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
HMGXB3Q12766 Y_RNA.434-201ENST00000384090 100 ntBASIC-3.27□□□□□ -2.93
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