Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SFTPCP11686 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-2.05□□□□□ -2.74
SFTPCP11686 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SFTPCP11686 Y_RNA.225-201ENST00000364326 97 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SFTPCP11686 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SFTPCP11686 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-2.06□□□□□ -2.74
SFTPCP11686 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SFTPCP11686 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SFTPCP11686 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SFTPCP11686 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-2.07□□□□□ -2.74
SFTPCP11686 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SFTPCP11686 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SFTPCP11686 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SFTPCP11686 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SFTPCP11686 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SFTPCP11686 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SFTPCP11686 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-2.08□□□□□ -2.74
SFTPCP11686 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SFTPCP11686 Y_RNA.103-201ENST00000363171 102 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SFTPCP11686 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SFTPCP11686 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SFTPCP11686 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SFTPCP11686 RNU6ATAC32P-201ENST00000516026 76 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SFTPCP11686 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SFTPCP11686 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC-2.09□□□□□ -2.74
SFTPCP11686 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SFTPCP11686 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SFTPCP11686 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SFTPCP11686 RNU6-1152P-201ENST00000384576 107 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SFTPCP11686 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SFTPCP11686 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SFTPCP11686 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC-2.1□□□□□ -2.75
SFTPCP11686 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SFTPCP11686 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SFTPCP11686 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SFTPCP11686 Y_RNA.459-201ENST00000384251 102 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SFTPCP11686 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SFTPCP11686 RNU6-1262P-201ENST00000516217 96 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SFTPCP11686 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-2.11□□□□□ -2.75
SFTPCP11686 Y_RNA.74-201ENST00000362911 99 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SFTPCP11686 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SFTPCP11686 Y_RNA.502-201ENST00000384478 113 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SFTPCP11686 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SFTPCP11686 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-2.12□□□□□ -2.75
SFTPCP11686 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SFTPCP11686 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SFTPCP11686 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SFTPCP11686 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SFTPCP11686 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SFTPCP11686 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC-2.13□□□□□ -2.75
SFTPCP11686 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SFTPCP11686 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-2.14□□□□□ -2.75
SFTPCP11686 MIR429-201ENST00000362106 83 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SFTPCP11686 Y_RNA.282-201ENST00000364793 102 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SFTPCP11686 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SFTPCP11686 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SFTPCP11686 MIR664B-201ENST00000626756 61 ntBASIC-2.15□□□□□ -2.75
SFTPCP11686 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SFTPCP11686 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SFTPCP11686 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SFTPCP11686 SCARNA23-201ENST00000516060 130 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SFTPCP11686 RNU6-904P-201ENST00000516206 101 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SFTPCP11686 RNU6-118P-201ENST00000516552 102 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SFTPCP11686 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SFTPCP11686 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-2.16□□□□□ -2.76
SFTPCP11686 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SFTPCP11686 Y_RNA.421-201ENST00000384052 101 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SFTPCP11686 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-2.17□□□□□ -2.76
SFTPCP11686 RNA5SP93-201ENST00000362525 114 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SFTPCP11686 RNU6-598P-201ENST00000364017 105 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SFTPCP11686 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SFTPCP11686 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SFTPCP11686 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-2.18□□□□□ -2.76
SFTPCP11686 SNORD54-201ENST00000459159 67 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SFTPCP11686 MIR3914-2-201ENST00000637339 95 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
SFTPCP11686 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SFTPCP11686 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SFTPCP11686 RNY4-201ENST00000516507 96 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SFTPCP11686 AC120024.2-201ENST00000576526 175 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SFTPCP11686 Y_RNA.781-201ENST00000620301 103 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
SFTPCP11686 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SFTPCP11686 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SFTPCP11686 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-2.21□□□□□ -2.76
SFTPCP11686 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SFTPCP11686 AC008737.2-201ENST00000599446 118 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
SFTPCP11686 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SFTPCP11686 RNU6-563P-201ENST00000364872 108 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SFTPCP11686 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SFTPCP11686 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SFTPCP11686 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SFTPCP11686 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SFTPCP11686 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.76
SFTPCP11686 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SFTPCP11686 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SFTPCP11686 Y_RNA.449-201ENST00000384187 102 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SFTPCP11686 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SFTPCP11686 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SFTPCP11686 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SFTPCP11686 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
SFTPCP11686 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms