Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ITGAMP11215 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ITGAMP11215 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ITGAMP11215 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ITGAMP11215 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
ITGAMP11215 CEP290-203ENST00000547691 5968 ntTSL 1 (best) BASIC0.31□□□□□ -2.36
ITGAMP11215 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ITGAMP11215 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ITGAMP11215 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
ITGAMP11215 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ITGAMP11215 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC0.3□□□□□ -2.36
ITGAMP11215 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.3□□□□□ -2.36
ITGAMP11215 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ITGAMP11215 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
ITGAMP11215 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ITGAMP11215 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ITGAMP11215 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ITGAMP11215 MIR4315-1-201ENST00000636800 73 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ITGAMP11215 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ITGAMP11215 MIR4315-2-201ENST00000640925 73 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
ITGAMP11215 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ITGAMP11215 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ITGAMP11215 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC0.27□□□□□ -2.37
ITGAMP11215 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
ITGAMP11215 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ITGAMP11215 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ITGAMP11215 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ITGAMP11215 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
ITGAMP11215 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ITGAMP11215 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ITGAMP11215 MIR4514-201ENST00000581410 57 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ITGAMP11215 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
ITGAMP11215 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ITGAMP11215 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ITGAMP11215 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ITGAMP11215 RNU6-180P-201ENST00000516697 61 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ITGAMP11215 MIR6514-201ENST00000622549 70 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
ITGAMP11215 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ITGAMP11215 RNA5SP163-201ENST00000410304 99 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ITGAMP11215 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
ITGAMP11215 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ITGAMP11215 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ITGAMP11215 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ITGAMP11215 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ITGAMP11215 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ITGAMP11215 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
ITGAMP11215 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ITGAMP11215 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ITGAMP11215 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ITGAMP11215 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
ITGAMP11215 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ITGAMP11215 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ITGAMP11215 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ITGAMP11215 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ITGAMP11215 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ITGAMP11215 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
ITGAMP11215 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ITGAMP11215 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ITGAMP11215 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ITGAMP11215 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ITGAMP11215 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ITGAMP11215 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ITGAMP11215 RNU6-518P-201ENST00000516056 96 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ITGAMP11215 SNORA62.5-201ENST00000516634 120 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ITGAMP11215 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ITGAMP11215 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
ITGAMP11215 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ITGAMP11215 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ITGAMP11215 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ITGAMP11215 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ITGAMP11215 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ITGAMP11215 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.18□□□□□ -2.38
ITGAMP11215 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ITGAMP11215 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
ITGAMP11215 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ITGAMP11215 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ITGAMP11215 RNU6-1246P-201ENST00000391064 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ITGAMP11215 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ITGAMP11215 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ITGAMP11215 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
ITGAMP11215 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.16□□□□□ -2.38
ITGAMP11215 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ITGAMP11215 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
ITGAMP11215 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
ITGAMP11215 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ITGAMP11215 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ITGAMP11215 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ITGAMP11215 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ITGAMP11215 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
ITGAMP11215 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ITGAMP11215 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ITGAMP11215 Y_RNA.325-201ENST00000365171 122 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ITGAMP11215 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ITGAMP11215 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ITGAMP11215 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
ITGAMP11215 SNORA25.5-201ENST00000363782 126 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ITGAMP11215 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
ITGAMP11215 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ITGAMP11215 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
ITGAMP11215 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 203.6 ms