Protein–RNA interactions for Protein: O94906

PRPF6, Pre-mRNA-processing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF6O94906 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PRPF6O94906 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PRPF6O94906 MIR4662A-201ENST00000637499 67 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
PRPF6O94906 RNU6-411P-201ENST00000384451 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PRPF6O94906 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PRPF6O94906 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PRPF6O94906 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PRPF6O94906 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PRPF6O94906 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PRPF6O94906 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PRPF6O94906 RNU6-638P-201ENST00000516582 104 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
PRPF6O94906 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PRPF6O94906 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PRPF6O94906 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PRPF6O94906 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PRPF6O94906 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC0.11□□□□□ -2.39
PRPF6O94906 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PRPF6O94906 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PRPF6O94906 RNU6-776P-201ENST00000364403 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PRPF6O94906 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PRPF6O94906 RNU6-1022P-201ENST00000365049 104 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PRPF6O94906 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PRPF6O94906 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PRPF6O94906 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PRPF6O94906 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PRPF6O94906 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
PRPF6O94906 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PRPF6O94906 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PRPF6O94906 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
PRPF6O94906 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PRPF6O94906 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PRPF6O94906 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
PRPF6O94906 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PRPF6O94906 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
PRPF6O94906 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PRPF6O94906 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PRPF6O94906 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PRPF6O94906 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PRPF6O94906 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
PRPF6O94906 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PRPF6O94906 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PRPF6O94906 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PRPF6O94906 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PRPF6O94906 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PRPF6O94906 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PRPF6O94906 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PRPF6O94906 RNU6-523P-201ENST00000516304 54 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PRPF6O94906 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC0.03□□□□□ -2.4
PRPF6O94906 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PRPF6O94906 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PRPF6O94906 MIR4667-201ENST00000578933 66 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PRPF6O94906 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PRPF6O94906 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PRPF6O94906 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.02□□□□□ -2.41
PRPF6O94906 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PRPF6O94906 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PRPF6O94906 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PRPF6O94906 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PRPF6O94906 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PRPF6O94906 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC0□□□□□ -2.41
PRPF6O94906 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRPF6O94906 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRPF6O94906 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRPF6O94906 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRPF6O94906 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRPF6O94906 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
PRPF6O94906 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PRPF6O94906 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PRPF6O94906 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PRPF6O94906 RNU6-1296P-201ENST00000383879 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PRPF6O94906 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.03□□□□□ -2.41
PRPF6O94906 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.03□□□□□ -2.41
PRPF6O94906 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRPF6O94906 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRPF6O94906 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.04□□□□□ -2.42
PRPF6O94906 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
PRPF6O94906 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PRPF6O94906 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
PRPF6O94906 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PRPF6O94906 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PRPF6O94906 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PRPF6O94906 MIR1295B-201ENST00000636144 60 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
PRPF6O94906 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PRPF6O94906 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PRPF6O94906 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PRPF6O94906 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
PRPF6O94906 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PRPF6O94906 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PRPF6O94906 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PRPF6O94906 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
PRPF6O94906 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PRPF6O94906 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
PRPF6O94906 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
PRPF6O94906 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PRPF6O94906 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PRPF6O94906 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PRPF6O94906 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PRPF6O94906 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PRPF6O94906 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
PRPF6O94906 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 410.9 ms