Protein–RNA interactions for Protein: Q9R000

Itgb1bp2, Integrin beta-1-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1bp2Q9R000 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1bp2Q9R000 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1bp2Q9R000 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1bp2Q9R000 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1bp2Q9R000 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1bp2Q9R000 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1bp2Q9R000 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1bp2Q9R000 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1bp2Q9R000 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1bp2Q9R000 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1bp2Q9R000 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Itgb1bp2Q9R000 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Itgb1bp2Q9R000 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms