Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
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SNX13Q9Y5W8 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SNX13Q9Y5W8 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SNX13Q9Y5W8 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SNX13Q9Y5W8 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SNX13Q9Y5W8 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SNX13Q9Y5W8 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SNX13Q9Y5W8 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SNX13Q9Y5W8 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SNX13Q9Y5W8 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SNX13Q9Y5W8 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
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SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SNX13Q9Y5W8 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SNX13Q9Y5W8 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SNX13Q9Y5W8 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SNX13Q9Y5W8 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SNX13Q9Y5W8 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SNX13Q9Y5W8 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
SNX13Q9Y5W8 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
SNX13Q9Y5W8 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SNX13Q9Y5W8 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SNX13Q9Y5W8 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SNX13Q9Y5W8 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
SNX13Q9Y5W8 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-0.45□□□□□ -2.48
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SNX13Q9Y5W8 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SNX13Q9Y5W8 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SNX13Q9Y5W8 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SNX13Q9Y5W8 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-0.46□□□□□ -2.48
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SNX13Q9Y5W8 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SNX13Q9Y5W8 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SNX13Q9Y5W8 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
SNX13Q9Y5W8 Y_RNA.696-201ENST00000516725 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
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SNX13Q9Y5W8 SNORD14C-201ENST00000365382 88 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
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SNX13Q9Y5W8 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
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SNX13Q9Y5W8 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.54□□□□□ -2.5
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SNX13Q9Y5W8 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.56□□□□□ -2.5
SNX13Q9Y5W8 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SNX13Q9Y5W8 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
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SNX13Q9Y5W8 RNU6-284P-201ENST00000411105 106 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SNX13Q9Y5W8 AC114755.3-201ENST00000481111 251 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SNX13Q9Y5W8 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SNX13Q9Y5W8 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.57□□□□□ -2.5
SNX13Q9Y5W8 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SNX13Q9Y5W8 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SNX13Q9Y5W8 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SNX13Q9Y5W8 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
SNX13Q9Y5W8 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.58□□□□□ -2.5
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