Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
FOXQ1Q9C009 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
FOXQ1Q9C009 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
FOXQ1Q9C009 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
FOXQ1Q9C009 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
FOXQ1Q9C009 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
FOXQ1Q9C009 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
FOXQ1Q9C009 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
FOXQ1Q9C009 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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FOXQ1Q9C009 MIR521-2-201ENST00000384818 87 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
FOXQ1Q9C009 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
FOXQ1Q9C009 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
FOXQ1Q9C009 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
FOXQ1Q9C009 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC0.89□□□□□ -2.27
FOXQ1Q9C009 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
FOXQ1Q9C009 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
FOXQ1Q9C009 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
FOXQ1Q9C009 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
FOXQ1Q9C009 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
FOXQ1Q9C009 MIR6513-201ENST00000621188 64 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
FOXQ1Q9C009 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
FOXQ1Q9C009 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
FOXQ1Q9C009 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
FOXQ1Q9C009 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
FOXQ1Q9C009 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
FOXQ1Q9C009 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
FOXQ1Q9C009 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
FOXQ1Q9C009 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
FOXQ1Q9C009 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
FOXQ1Q9C009 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
FOXQ1Q9C009 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
FOXQ1Q9C009 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
FOXQ1Q9C009 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
FOXQ1Q9C009 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
FOXQ1Q9C009 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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FOXQ1Q9C009 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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FOXQ1Q9C009 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC0.83□□□□□ -2.28
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FOXQ1Q9C009 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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FOXQ1Q9C009 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.81□□□□□ -2.28
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FOXQ1Q9C009 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
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FOXQ1Q9C009 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
FOXQ1Q9C009 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
FOXQ1Q9C009 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
FOXQ1Q9C009 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
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FOXQ1Q9C009 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
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