Protein–RNA interactions for Protein: Q92623

TTC9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9Q92623 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TTC9Q92623 MIR548AE1-201ENST00000583292 70 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
TTC9Q92623 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
TTC9Q92623 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TTC9Q92623 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
TTC9Q92623 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
TTC9Q92623 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TTC9Q92623 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TTC9Q92623 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TTC9Q92623 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TTC9Q92623 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
TTC9Q92623 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
TTC9Q92623 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TTC9Q92623 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
TTC9Q92623 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
TTC9Q92623 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TTC9Q92623 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TTC9Q92623 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
TTC9Q92623 Y_RNA.125-201ENST00000363371 111 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TTC9Q92623 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TTC9Q92623 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TTC9Q92623 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TTC9Q92623 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TTC9Q92623 U2.7-201ENST00000619197 100 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
TTC9Q92623 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TTC9Q92623 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TTC9Q92623 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TTC9Q92623 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TTC9Q92623 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TTC9Q92623 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TTC9Q92623 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TTC9Q92623 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
TTC9Q92623 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
TTC9Q92623 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TTC9Q92623 AC069271.1-201ENST00000445577 156 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TTC9Q92623 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
TTC9Q92623 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
TTC9Q92623 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
TTC9Q92623 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TTC9Q92623 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TTC9Q92623 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TTC9Q92623 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TTC9Q92623 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TTC9Q92623 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
TTC9Q92623 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
TTC9Q92623 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TTC9Q92623 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TTC9Q92623 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TTC9Q92623 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
TTC9Q92623 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
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TTC9Q92623 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
TTC9Q92623 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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TTC9Q92623 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
TTC9Q92623 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.25
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TTC9Q92623 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TTC9Q92623 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TTC9Q92623 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
TTC9Q92623 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
TTC9Q92623 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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TTC9Q92623 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
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TTC9Q92623 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC1□□□□□ -2.25
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TTC9Q92623 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TTC9Q92623 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TTC9Q92623 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
TTC9Q92623 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
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TTC9Q92623 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
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TTC9Q92623 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TTC9Q92623 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
TTC9Q92623 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TTC9Q92623 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TTC9Q92623 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TTC9Q92623 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
TTC9Q92623 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
TTC9Q92623 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
TTC9Q92623 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
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TTC9Q92623 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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