Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RNF20Q5VTR2 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RNF20Q5VTR2 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RNF20Q5VTR2 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RNF20Q5VTR2 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RNF20Q5VTR2 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RNF20Q5VTR2 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RNF20Q5VTR2 RNU6-940P-201ENST00000363433 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RNF20Q5VTR2 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RNF20Q5VTR2 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RNF20Q5VTR2 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
RNF20Q5VTR2 MIR20A-201ENST00000362279 71 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RNF20Q5VTR2 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RNF20Q5VTR2 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RNF20Q5VTR2 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
RNF20Q5VTR2 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RNF20Q5VTR2 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RNF20Q5VTR2 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RNF20Q5VTR2 AC244090.1-201ENST00000441884 93 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RNF20Q5VTR2 AC243829.6-201ENST00000612652 106 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
RNF20Q5VTR2 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RNF20Q5VTR2 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RNF20Q5VTR2 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RNF20Q5VTR2 RNU7-188P-201ENST00000517063 64 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RNF20Q5VTR2 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RNF20Q5VTR2 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RNF20Q5VTR2 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC1□□□□□ -2.25
RNF20Q5VTR2 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RNF20Q5VTR2 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RNF20Q5VTR2 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RNF20Q5VTR2 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
RNF20Q5VTR2 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
RNF20Q5VTR2 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RNF20Q5VTR2 SNORD114-29-201ENST00000364819 70 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RNF20Q5VTR2 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
RNF20Q5VTR2 MIR373-201ENST00000362273 69 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RNF20Q5VTR2 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
RNF20Q5VTR2 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RNF20Q5VTR2 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RNF20Q5VTR2 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RNF20Q5VTR2 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
RNF20Q5VTR2 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RNF20Q5VTR2 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RNF20Q5VTR2 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RNF20Q5VTR2 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
RNF20Q5VTR2 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RNF20Q5VTR2 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
RNF20Q5VTR2 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
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RNF20Q5VTR2 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
RNF20Q5VTR2 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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RNF20Q5VTR2 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
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RNF20Q5VTR2 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
RNF20Q5VTR2 RNU6-175P-201ENST00000516896 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
RNF20Q5VTR2 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
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RNF20Q5VTR2 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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RNF20Q5VTR2 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
RNF20Q5VTR2 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.89□□□□□ -2.27
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RNF20Q5VTR2 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
RNF20Q5VTR2 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
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RNF20Q5VTR2 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RNF20Q5VTR2 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RNF20Q5VTR2 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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RNF20Q5VTR2 RN7SL660P-201ENST00000614852 299 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RNF20Q5VTR2 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RNF20Q5VTR2 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RNF20Q5VTR2 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
RNF20Q5VTR2 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RNF20Q5VTR2 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RNF20Q5VTR2 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RNF20Q5VTR2 MIR6835-201ENST00000621552 64 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
RNF20Q5VTR2 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
RNF20Q5VTR2 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
RNF20Q5VTR2 MIR103A1-201ENST00000362165 78 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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