Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
RPE65Q16518 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
RPE65Q16518 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
RPE65Q16518 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
RPE65Q16518 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
RPE65Q16518 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
RPE65Q16518 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
RPE65Q16518 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
RPE65Q16518 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
RPE65Q16518 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RPE65Q16518 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RPE65Q16518 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RPE65Q16518 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RPE65Q16518 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RPE65Q16518 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RPE65Q16518 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
RPE65Q16518 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
RPE65Q16518 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
RPE65Q16518 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
RPE65Q16518 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
RPE65Q16518 IGLL4P-201ENST00000614590 133 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
RPE65Q16518 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
RPE65Q16518 SNORD114-31-201ENST00000363219 75 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
RPE65Q16518 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
RPE65Q16518 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
RPE65Q16518 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
RPE65Q16518 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
RPE65Q16518 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
RPE65Q16518 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
RPE65Q16518 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
RPE65Q16518 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
RPE65Q16518 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
RPE65Q16518 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
RPE65Q16518 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
RPE65Q16518 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
RPE65Q16518 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
RPE65Q16518 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
RPE65Q16518 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
RPE65Q16518 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
RPE65Q16518 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
RPE65Q16518 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
RPE65Q16518 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
RPE65Q16518 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
RPE65Q16518 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
RPE65Q16518 MIR4636-201ENST00000582271 80 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
RPE65Q16518 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
RPE65Q16518 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
RPE65Q16518 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
RPE65Q16518 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
RPE65Q16518 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
RPE65Q16518 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
RPE65Q16518 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
RPE65Q16518 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
RPE65Q16518 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
RPE65Q16518 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
RPE65Q16518 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
RPE65Q16518 RNU6-294P-201ENST00000364999 102 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
RPE65Q16518 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
RPE65Q16518 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
RPE65Q16518 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
RPE65Q16518 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
RPE65Q16518 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
RPE65Q16518 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
RPE65Q16518 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
RPE65Q16518 Y_RNA.178-201ENST00000363832 102 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
RPE65Q16518 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
RPE65Q16518 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
RPE65Q16518 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
RPE65Q16518 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
RPE65Q16518 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
RPE65Q16518 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
RPE65Q16518 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
RPE65Q16518 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
RPE65Q16518 MIR4645-201ENST00000583158 77 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
RPE65Q16518 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-0.36□□□□□ -2.47
RPE65Q16518 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
RPE65Q16518 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
RPE65Q16518 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
RPE65Q16518 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
RPE65Q16518 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
RPE65Q16518 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
RPE65Q16518 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
RPE65Q16518 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
RPE65Q16518 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
RPE65Q16518 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
RPE65Q16518 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
RPE65Q16518 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
RPE65Q16518 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
RPE65Q16518 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
RPE65Q16518 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
RPE65Q16518 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
RPE65Q16518 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
RPE65Q16518 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
RPE65Q16518 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
RPE65Q16518 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
RPE65Q16518 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
RPE65Q16518 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
RPE65Q16518 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
RPE65Q16518 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
RPE65Q16518 MIR494-201ENST00000349529 81 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
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