Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
SCN9AQ15858 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.65
SCN9AQ15858 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.65
SCN9AQ15858 RNU7-134P-201ENST00000458997 64 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.65
SCN9AQ15858 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SCN9AQ15858 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SCN9AQ15858 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SCN9AQ15858 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SCN9AQ15858 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SCN9AQ15858 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SCN9AQ15858 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SCN9AQ15858 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SCN9AQ15858 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SCN9AQ15858 Y_RNA.96-201ENST00000363092 109 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SCN9AQ15858 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SCN9AQ15858 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SCN9AQ15858 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SCN9AQ15858 Y_RNA.489-201ENST00000384410 101 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SCN9AQ15858 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SCN9AQ15858 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
SCN9AQ15858 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SCN9AQ15858 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SCN9AQ15858 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
SCN9AQ15858 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SCN9AQ15858 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SCN9AQ15858 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SCN9AQ15858 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.51□□□□□ -2.65
SCN9AQ15858 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SCN9AQ15858 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SCN9AQ15858 AC104996.3-201ENST00000590718 94 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SCN9AQ15858 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SCN9AQ15858 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SCN9AQ15858 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SCN9AQ15858 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SCN9AQ15858 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SCN9AQ15858 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SCN9AQ15858 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SCN9AQ15858 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SCN9AQ15858 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SCN9AQ15858 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SCN9AQ15858 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SCN9AQ15858 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SCN9AQ15858 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SCN9AQ15858 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SCN9AQ15858 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SCN9AQ15858 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SCN9AQ15858 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SCN9AQ15858 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SCN9AQ15858 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SCN9AQ15858 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SCN9AQ15858 AL021921.1-201ENST00000442774 93 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SCN9AQ15858 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SCN9AQ15858 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SCN9AQ15858 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SCN9AQ15858 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SCN9AQ15858 RNU6-327P-201ENST00000516270 127 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SCN9AQ15858 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SCN9AQ15858 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SCN9AQ15858 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SCN9AQ15858 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SCN9AQ15858 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SCN9AQ15858 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SCN9AQ15858 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SCN9AQ15858 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SCN9AQ15858 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SCN9AQ15858 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SCN9AQ15858 MIR507-201ENST00000385234 94 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SCN9AQ15858 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SCN9AQ15858 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SCN9AQ15858 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SCN9AQ15858 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC-1.57□□□□□ -2.66
SCN9AQ15858 MIR6502-201ENST00000617296 76 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SCN9AQ15858 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SCN9AQ15858 AL078595.1-201ENST00000404458 226 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SCN9AQ15858 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SCN9AQ15858 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SCN9AQ15858 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SCN9AQ15858 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SCN9AQ15858 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SCN9AQ15858 Y_RNA.223-201ENST00000364290 113 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SCN9AQ15858 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SCN9AQ15858 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SCN9AQ15858 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SCN9AQ15858 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SCN9AQ15858 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SCN9AQ15858 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SCN9AQ15858 RNU6-119P-201ENST00000364882 107 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SCN9AQ15858 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SCN9AQ15858 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SCN9AQ15858 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SCN9AQ15858 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SCN9AQ15858 RNU6-1045P-201ENST00000516321 107 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SCN9AQ15858 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SCN9AQ15858 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SCN9AQ15858 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SCN9AQ15858 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SCN9AQ15858 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SCN9AQ15858 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SCN9AQ15858 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
SCN9AQ15858 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
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