Protein–RNA interactions for Protein: Q15771

RAB30, Ras-related protein Rab-30, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB30Q15771 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
RAB30Q15771 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
RAB30Q15771 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
RAB30Q15771 SNORD49B-201ENST00000365172 72 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
RAB30Q15771 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
RAB30Q15771 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
RAB30Q15771 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
RAB30Q15771 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
RAB30Q15771 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
RAB30Q15771 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
RAB30Q15771 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
RAB30Q15771 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
RAB30Q15771 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
RAB30Q15771 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
RAB30Q15771 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
RAB30Q15771 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.32□□□□□ -2.46
RAB30Q15771 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.32□□□□□ -2.46
RAB30Q15771 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
RAB30Q15771 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
RAB30Q15771 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
RAB30Q15771 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
RAB30Q15771 RNA5SP89-201ENST00000410300 108 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
RAB30Q15771 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
RAB30Q15771 MIR3666-201ENST00000607845 111 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
RAB30Q15771 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
RAB30Q15771 AP000676.1-201ENST00000533307 52 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
RAB30Q15771 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
RAB30Q15771 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
RAB30Q15771 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
RAB30Q15771 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
RAB30Q15771 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
RAB30Q15771 MIR8064-201ENST00000612863 90 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
RAB30Q15771 RNU6-219P-201ENST00000364728 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
RAB30Q15771 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
RAB30Q15771 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
RAB30Q15771 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
RAB30Q15771 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
RAB30Q15771 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
RAB30Q15771 RNA5SP266-201ENST00000410273 108 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
RAB30Q15771 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
RAB30Q15771 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
RAB30Q15771 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
RAB30Q15771 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
RAB30Q15771 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
RAB30Q15771 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
RAB30Q15771 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
RAB30Q15771 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
RAB30Q15771 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
RAB30Q15771 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
RAB30Q15771 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
RAB30Q15771 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
RAB30Q15771 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
RAB30Q15771 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
RAB30Q15771 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
RAB30Q15771 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
RAB30Q15771 RNU6-1134P-201ENST00000365156 101 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
RAB30Q15771 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
RAB30Q15771 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
RAB30Q15771 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
RAB30Q15771 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
RAB30Q15771 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
RAB30Q15771 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
RAB30Q15771 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
RAB30Q15771 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
RAB30Q15771 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
RAB30Q15771 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
RAB30Q15771 RNU6-675P-201ENST00000384236 104 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
RAB30Q15771 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
RAB30Q15771 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
RAB30Q15771 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
RAB30Q15771 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
RAB30Q15771 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
RAB30Q15771 RNU6-624P-201ENST00000363411 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
RAB30Q15771 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
RAB30Q15771 Y_RNA.457-201ENST00000384237 111 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
RAB30Q15771 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
RAB30Q15771 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
RAB30Q15771 MIR548AX-201ENST00000580117 73 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
RAB30Q15771 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.45□□□□□ -2.48
RAB30Q15771 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
RAB30Q15771 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
RAB30Q15771 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
RAB30Q15771 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-0.46□□□□□ -2.48
RAB30Q15771 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
RAB30Q15771 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
RAB30Q15771 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
RAB30Q15771 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
RAB30Q15771 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
RAB30Q15771 RNU6-320P-201ENST00000516511 106 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
RAB30Q15771 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.47□□□□□ -2.48
RAB30Q15771 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-0.47□□□□□ -2.48
RAB30Q15771 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RAB30Q15771 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RAB30Q15771 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RAB30Q15771 RNA5SP66-201ENST00000517178 101 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RAB30Q15771 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-0.48□□□□□ -2.49
RAB30Q15771 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RAB30Q15771 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
RAB30Q15771 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
RAB30Q15771 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 298.9 ms