Protein–RNA interactions for Protein: Q15046

KARS, Lysine--tRNA ligase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KARSQ15046 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
KARSQ15046 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
KARSQ15046 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
KARSQ15046 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-0.94□□□□□ -2.56
KARSQ15046 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
KARSQ15046 SNORD74.6-201ENST00000364796 70 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
KARSQ15046 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
KARSQ15046 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
KARSQ15046 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
KARSQ15046 Y_RNA.261-201ENST00000364631 102 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
KARSQ15046 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
KARSQ15046 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
KARSQ15046 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
KARSQ15046 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
KARSQ15046 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
KARSQ15046 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
KARSQ15046 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
KARSQ15046 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
KARSQ15046 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
KARSQ15046 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
KARSQ15046 MIR1468-201ENST00000410600 86 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
KARSQ15046 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
KARSQ15046 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
KARSQ15046 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
KARSQ15046 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
KARSQ15046 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
KARSQ15046 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
KARSQ15046 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
KARSQ15046 Y_RNA.583-201ENST00000391033 113 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
KARSQ15046 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
KARSQ15046 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
KARSQ15046 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
KARSQ15046 Y_RNA.558-201ENST00000384685 113 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
KARSQ15046 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
KARSQ15046 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
KARSQ15046 AP000533.3-201ENST00000447704 118 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
KARSQ15046 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
KARSQ15046 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
KARSQ15046 RNU6-106P-201ENST00000384405 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
KARSQ15046 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
KARSQ15046 AC020913.3-201ENST00000594678 125 ntTSL 3 BASIC-1.01□□□□□ -2.57
KARSQ15046 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
KARSQ15046 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
KARSQ15046 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
KARSQ15046 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
KARSQ15046 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC-1.02□□□□□ -2.57
KARSQ15046 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
KARSQ15046 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
KARSQ15046 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
KARSQ15046 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
KARSQ15046 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
KARSQ15046 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
KARSQ15046 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
KARSQ15046 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
KARSQ15046 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
KARSQ15046 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
KARSQ15046 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
KARSQ15046 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
KARSQ15046 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
KARSQ15046 Y_RNA.818-201ENST00000618813 71 ntBASIC-1.03□□□□□ -2.57
KARSQ15046 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
KARSQ15046 Y_RNA.250-201ENST00000364542 110 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
KARSQ15046 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
KARSQ15046 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
KARSQ15046 AL365222.1-201ENST00000614661 98 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
KARSQ15046 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC-1.04□□□□□ -2.58
KARSQ15046 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
KARSQ15046 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
KARSQ15046 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
KARSQ15046 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
KARSQ15046 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
KARSQ15046 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
KARSQ15046 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
KARSQ15046 MIR4723-201ENST00000585070 81 ntBASIC-1.05□□□□□ -2.58
KARSQ15046 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
KARSQ15046 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
KARSQ15046 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC-1.06□□□□□ -2.58
KARSQ15046 Y_RNA.246-201ENST00000364495 108 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
KARSQ15046 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-1.07□□□□□ -2.58
KARSQ15046 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
KARSQ15046 TRAJ57-201ENST00000390482 63 ntAPPRIS P1 BASIC-1.08□□□□□ -2.58
KARSQ15046 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
KARSQ15046 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
KARSQ15046 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
KARSQ15046 MIR4464-201ENST00000580818 92 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
KARSQ15046 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
KARSQ15046 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
KARSQ15046 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
KARSQ15046 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
KARSQ15046 MT-TR-201ENST00000387439 65 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
KARSQ15046 RNA5SP470-201ENST00000516463 106 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
KARSQ15046 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
KARSQ15046 SNORD114-25-201ENST00000363742 72 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
KARSQ15046 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
KARSQ15046 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
KARSQ15046 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
KARSQ15046 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
KARSQ15046 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
KARSQ15046 AL445584.3-201ENST00000617173 78 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
KARSQ15046 MIR6888-201ENST00000621977 67 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms