Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
SHPRHQ149N8 Y_RNA.109-201ENST00000363215 102 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
SHPRHQ149N8 MIR548C-201ENST00000384815 97 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
SHPRHQ149N8 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
SHPRHQ149N8 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC-3.62□□□□□ -2.99
SHPRHQ149N8 Y_RNA.349-201ENST00000365406 102 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
SHPRHQ149N8 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC-3.63□□□□□ -2.99
SHPRHQ149N8 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC-3.64□□□□□ -2.99
SHPRHQ149N8 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
SHPRHQ149N8 Y_RNA.266-201ENST00000364678 96 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
SHPRHQ149N8 RNU6-1044P-201ENST00000384755 107 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
SHPRHQ149N8 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
SHPRHQ149N8 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
SHPRHQ149N8 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
SHPRHQ149N8 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
SHPRHQ149N8 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC-3.65□□□□□ -2.99
SHPRHQ149N8 Y_RNA.657-201ENST00000515983 102 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC-3.66□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-3.67□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-3.68□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC-3.69□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 MIRLET7A3-201ENST00000362116 74 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 RNU6-995P-201ENST00000391244 107 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 RNU7-151P-201ENST00000516930 53 ntBASIC-3.7□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-3.71□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC-3.71□□□□□ -3
SHPRHQ149N8 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC-3.72□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC-3.72□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC-3.73□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 RNY3P8-201ENST00000411366 126 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC-3.74□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 RNU6-1277P-201ENST00000364561 107 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 SNORD113-2-201ENST00000391082 72 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC-3.75□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 RNY4P18-201ENST00000391107 89 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-3.76□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC-3.76□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC-3.77□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.01
SHPRHQ149N8 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 MIR581-201ENST00000384895 96 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 SNORD63.2-201ENST00000516303 64 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-3.78□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC-3.79□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC-3.8□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 RNU6-912P-201ENST00000363800 104 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC-3.81□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 RNU6-828P-201ENST00000364876 107 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
SHPRHQ149N8 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC-3.82□□□□□ -3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.7 ms